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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004191`

染色体: Chr02 坐标: 64233692-64234493 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004191`
名称	SmilChr02G004191
描述	uncharacterized SmilChr02G004191
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	64233692 - 64234493 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009883`
GeneID	`131009883`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009883`
原始查询	`LOC131009883`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ribonuclease 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814828]; symbol=RNS1; hit=AT2G02990; species=arabidopsis; confidence=low
产物	ribonuclease 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814828]; symbol=RNS1; hit=AT2G02990; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT2G02990` (RNS1) ribonuclease 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814828] identity=28.1; qcov=0.9; evalue=3.03e-07; confidence=low
Rice	`Os07g0630400` (OsRNS1) - identity=26.8; qcov=0.659; evalue=4.54e-07; confidence=low
GO	GO:0003723 (RNA binding); GO:0005576 (extracellular region); GO:0006401 (RNA catabolic process); GO:0033897 (ribonuclease T2 activity)
KEGG	-
Pfam	PF00445 (Ribonuclease_T2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009883

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057793270.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057793270.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793270.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057793270.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057793270.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:64233733`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B125,B17,B90,B92,C79
`Chr2:64233755`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B108,C23
`Chr2:64233757`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C83
`Chr2:64233761`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B69
`Chr2:64233788`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	5	A19,C58,C64,C66,C7
`Chr2:64233788`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A19,C58,C64,C66,C7
`Chr2:64233793`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B1,B104,B35
`Chr2:64233798`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B12,B86
`Chr2:64234111`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B35
`Chr2:64234145`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	18	B10,B131,B136,B33,B37,B55,B57,B9,C23,C30,C39,C49,C56,C65,C67,C82,C86,D11
`Chr2:64234152`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C51
`Chr2:64234166`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C17

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793270.1

170 aa

170

Ribonuclease_T2

PF00445 Ribonuclease_T2 13-157 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793270.1`	Pfam	`PF00445`	Ribonuclease_T2	Domain	13	157	2.6e-14	54.5	Ribonuclease T2 family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937287.1
ATGGTACTAGCCTTGCAATGGTCGGAGGCACATGGTTGCTTCCTCATACATGGCTTGTGGCCGGTCATACTTGGTGTGCCGCATCATATTGTTAATCAGCCCATCCGCAATCCATATGTAGTTTCAAATGGTCTAGATTGGACACTTCTCAATGAAATGGCTGTTGTCTGGCCGGATGTGATACACAGAAATAACTATCAACTGTGGCAACATGAATGGGACGTCCACGGCACGCGATCCGGATTGTCATTTGAAAACTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009883
ATGGTACTAGCCTTGCAATGGTCGGAGGCACATGGTTGCTTCCTCATACATGGCTTGTGGCCGGTCATACTTGGTGTGCCGCATCATATTGTTAATCAGCCCATCCGCAATCCATATGTAGTTTCAAATGGTCTAGATTGGACACTTCTCAATGAAATGGCTGTTGTCTGGCCGGATGTGATACACAGAAATAACTATCAACTGTGGCAACATGAATGGGACGTCCACGGCACGCGATCCGGATTGTCATTTGAAAACTA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793270.1
MVLALQWSEAHGCFLIHGLWPVILGVPHHIVNQPIRNPYVVSNGLDWTLLNEMAVVWPDVIHRNNYQLWQHEWDVHGTRSGLSFENYFRVAVELYRSLGPRRVQLVTSLTFSKGDEATLRQIHMKIYEQTGLVVAIKTGPRKSSCFNRMTEIYVGVDRMCGFRHITQDLN

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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