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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004457`

染色体: Chr02 坐标: 66981109-66982251 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004457`
名称	SmilChr02G004457
描述	uncharacterized SmilChr02G004457
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	66981109 - 66982251 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009908`
GeneID	`131009908`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009908`
原始查询	`LOC131009908`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os12g0156200; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os12g0156200; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT2G41590` (AT2G41590) Ta11-like non-LTR retrotransposon [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818757] identity=25.5; qcov=0.558; evalue=9.72e-18; confidence=low
Rice	`Os12g0156200` - identity=30.7; qcov=0.505; evalue=8.23e-20; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF14111 (DUF4283); PF14392 (zf-CCHC_4)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009908

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057793291.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057793291.1`
3	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057793291.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793291.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057793291.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:66981195`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B111,B31,C56,C61,C65
`Chr2:66981205`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B102
`Chr2:66981253`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C23
`Chr2:66981253`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C23
`Chr2:66981261`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B111,B31,C56,C61,C65
`Chr2:66981368`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C84
`Chr2:66981381`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B120,B14,B46,C82
`Chr2:66981386`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B46,C82
`Chr2:66981386`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B46,C82
`Chr2:66981394`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C82
`Chr2:66981394`	`T`	`TG`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C82
`Chr2:66981407`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B9,C54,C86

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793291.1

380 aa

190

380

DUF4283

zf-CCHC_4

PF14111 DUF4283 29-102 aa PF14392 zf-CCHC_4 168-213 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793291.1`	Pfam	`PF14111`	DUF4283	Domain	29	102	3.2e-18	65.9	Domain of unknown function (DUF4283)
`XP_057793291.1`	Pfam	`PF14392`	zf-CCHC_4	Domain	168	213	4.9e-17	62.0	Zinc knuckle

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937308.1
ATGGCAGGCTTAAACCTAATGGGAGAAGATGATGAACTTCTTCTTGATGATGAAGTTGCTGGTGATTCACCCGTTCCAGCAGATCTCTGTCTTGTTGGACGTTTCCTTACGGAACAGCCGATCAACTTTAATCTGATGCGGAGTCGATTGGCCAGTATATGGCGTCCAGGGAAAGGGGTCTTTATGAAAGATATTGGAGGAGGCAGATTTATCTTTCAGTTTTTCCATGAAGTTGATCTTGTTCGGGTGTATGAAGGAGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009908
ATGGCAGGCTTAAACCTAATGGGAGAAGATGATGAACTTCTTCTTGATGATGAAGTTGCTGGTGATTCACCCGTTCCAGCAGATCTCTGTCTTGTTGGACGTTTCCTTACGGAACAGCCGATCAACTTTAATCTGATGCGGAGTCGATTGGCCAGTATATGGCGTCCAGGGAAAGGGGTCTTTATGAAAGATATTGGAGGAGGCAGATTTATCTTTCAGTTTTTCCATGAAGTTGATCTTGTTCGGGTGTATGAAGGAGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793291.1
MAGLNLMGEDDELLLDDEVAGDSPVPADLCLVGRFLTEQPINFNLMRSRLASIWRPGKGVFMKDIGGGRFIFQFFHEVDLVRVYEGGPWAFGNFPLILHRLHRGEFPLSVPLDVLPFWVKIHDLPAGYITEGIGKLLGNFIGNFLEYDSTNSTGVWRQYMRIRVGIRVDEPLKRSKKIKSKDGSTFVVTFKYERLNVFCFLCGRLGHSENFCELMFNDEVKNKERQWGVGLKAADRRGQNLAGEKWIRTDGAGGNPSGVA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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