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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004462`

染色体: Chr02 坐标: 67036686-67037840 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004462`
名称	SmilChr02G004462
描述	uncharacterized SmilChr02G004462
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	67036686 - 67037840 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009909`
GeneID	`131009909`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009909`
原始查询	`LOC131009909`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	GO:0003723 (RNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF00076 (RRM_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009909

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057793292.1`
2	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057793292.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057793292.1`
4	Chloroplast	叶绿体	0.20000	`XP_057793292.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793292.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:67036690`	`TAG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	4	A3,A5,B113,C4
`Chr2:67036690`	`TAG`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	4	A3,A5,B113,C4
`Chr2:67036712`	`CAT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	73	A14,A20,A22,A8,B100,B102,B106,B110,B112,B114,B115,B119,B121,B125,B129,B132,B17,B22,B26,B36,B38,B39,B4,B52,B53,B55,B58,B60,B61,B62,B65,B67,B71,B72,B73,B74,B78,B79,B85,B99,C1,C11,C15,C17,C18,C19,C22,C23,C24,C29,C36,C38,C43,C46,C52,C55,C56,C58,C6,C61,C62,C63,C64,C65,C66,C69,C73,C80,C87,D10,D3,D5,D6
`Chr2:67036715`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	73	A14,A20,A22,A8,B100,B102,B106,B110,B112,B114,B115,B119,B121,B125,B129,B132,B17,B22,B26,B36,B38,B39,B4,B52,B53,B55,B58,B60,B61,B62,B65,B67,B71,B72,B73,B74,B78,B79,B85,B99,C1,C11,C15,C17,C18,C19,C22,C23,C24,C29,C36,C38,C43,C46,C52,C55,C56,C58,C6,C61,C62,C63,C64,C65,C66,C69,C73,C80,C87,D10,D3,D5,D6
`Chr2:67036717`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	4	A8,B9,C54,C86
`Chr2:67036717`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	4	A8,B9,C54,C86
`Chr2:67036720`	`TCC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	4	A8,B9,C54,C86
`Chr2:67036720`	`TCC`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	4	A8,B9,C54,C86
`Chr2:67036725`	`C`	`CG`	1bp_insertion	frameshift_variant	4	A14,B136,B53,C78
`Chr2:67036725`	`C`	`CG`	1bp_insertion	CDS_variant	4	A14,B136,B53,C78
`Chr2:67036747`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C67
`Chr2:67036747`	`GT`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C67

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793292.1

384 aa

192

384

RRM_1

PF00076 RRM_1 54-117 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793292.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	54	117	4.1e-07	30.5	RNA recognition motif

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937309.1
ATGGAGAAAGGAGGGAGAGAGGAAGAAGGGGAGTGGAGGGAGGTGAGAAGAAGGCATCTACAAAAACCCAACCTTAGGGATAACCAGCCACATCCAACAGTCGAGAATCATTTTGTTAAGAAGACACATGGAAAAGAAGAAGAAACTTTCTTCTTCAACAATTTTCTGGAAGAAACAAGGATTCAATACCTGGAGAGAAGATTCAAAGAGATTGGGAGAGTAATATATATTTTCTATCCCAAGAAAAGAGACATTAGGGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009909
ATGGAGAAAGGAGGGAGAGAGGAAGAAGGGGAGTGGAGGGAGGTGAGAAGAAGGCATCTACAAAAACCCAACCTTAGGGATAACCAGCCACATCCAACAGTCGAGAATCATTTTGTTAAGAAGACACATGGAAAAGAAGAAGAAACTTTCTTCTTCAACAATTTTCTGGAAGAAACAAGGATTCAATACCTGGAGAGAAGATTCAAAGAGATTGGGAGAGTAATATATATTTTCTATCCCAAGAAAAGAGACATTAGGGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793292.1
MEKGGREEEGEWREVRRRHLQKPNLRDNQPHPTVENHFVKKTHGKEEETFFFNNFLEETRIQYLERRFKEIGRVIYIFYPKKRDIRGKPFGFVRFQKRNDRDWILEEMNNIWIGSYKTRAYLPRFDRPLTETLNNKIGGVGNHAKERNESKRRVYNIPKGLRESGKTFAEALGGINKNHTPPADEVISFQASNEEMKWSQNSFTGFVKAEFAWEDFEEEINSKYASILKVSTLGGNLVLIQSLNQTHVKELMKELDEWTK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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