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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004485`

染色体: Chr02 坐标: 67320603-67321242 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004485`
名称	SmilChr02G004485
描述	uncharacterized SmilChr02G004485
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	67320603 - 67321242 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009912`
GeneID	`131009912`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009912`
原始查询	`LOC131009912`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os02g0118800; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os02g0118800; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G09510` (AT3G09510) Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820108] identity=25; qcov=0.87; evalue=2.52e-08; confidence=low
Rice	`Os02g0118800` - identity=26.2; qcov=0.995; evalue=1.62e-10; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13966 (zf-RVT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009912

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057793295.1`
2	Cell membrane	细胞膜	0.40000	`XP_057793295.1`
3	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057793295.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057793295.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793295.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:67320646`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	87	A1,A11,A13,A2,A21,A22,A9,B1,B101,B102,B105,B111,B117,B120,B122,B124,B126,B128,B13,B130,B131,B132,B133,B134,B16,B18,B19,B2,B21,B22,B23,B25,B26,B27,B29,B31,B37,B41,B49,B5,B52,B55,B57,B6,B60,B74,B75,B76,B8,B86,B88,B89,B9,B93,B99,C1,C16,C18,C2,C23,C24,C28,C29,C3,C35,C36,C41,C5,C50,C53,C55,C6,C61,C63,C72,C73,C74,C75,C79,C8,C84,C87,D1,D11,D2,D5,D7
`Chr2:67320671`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B130
`Chr2:67320756`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B32,C36
`Chr2:67320776`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	7	A19,B1,B102,B127,B74,C49,C84
`Chr2:67320813`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B84
`Chr2:67320813`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B84
`Chr2:67320821`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	137	A1,A10,A14,A18,A2,A20,A23,A24,A25,A3,A4,A5,A7,B10,B107,B108,B109,B11,B113,B120,B122,B123,B124,B125,B127,B128,B132,B133,B135,B136,B139,B14,B140,B15,B17,B18,B19,B2,B20,B21,B24,B27,B28,B3,B30,B32,B33,B34,B38,B39,B4,B42,B43,B44,B48,B49,B51,B54,B56,B59,B61,B63,B64,B66,B67,B68,B7,B70,B72,B76,B77,B80,B81,B83,B84,B85,B87,B88,B90,B91,B92,B94,B95,B96,B97,C10,C12,C13,C15,C16,C17,C18,C19,C2,C20,C25,C26,C3,C30,C31,C32,C33,C34,C36,C37,C41,C42,C46,C49,C50,C51,C53,C54,C56,C57,C59,C6,C60,C62,C65,C68,C7,C71,C72,C75,C76,C78,C79,C8,C81,C82,C85,D3,D5,D7,D8,D9
`Chr2:67320861`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B111
`Chr2:67320864`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A16,B102,B37,C39,C53
`Chr2:67320899`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	D11
`Chr2:67320899`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	D11
`Chr2:67320906`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793295.1

184 aa

184

zf-RVT

PF13966 zf-RVT 15-109 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793295.1`	Pfam	`PF13966`	zf-RVT	Domain	15	109	1e-18	68.5	zinc-binding in reverse transcriptase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937312.1
ATGGAGGATGGAGCTTCGGGACAGGGAGAGTGCGATGGGAACTACACCACAAAATCAGCCTACTCGGTCATTTTTGCGGGAGGTAACGATTCAGCGGCAGTCCAGAGACCCTCGGAGCTGAATGCGAGAGTGTGGAAAACGCCGGCGCCTCAGAAAACTATAGTCACGGCGTGGAGACTCCTTAAAAATAGACTTGCCACCTGTGACAACCTGGAAAAGAGGAAGGTGATGCTTGGCGATGAAGAGGTAAAGTGTAAATT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009912
ATGGAGGATGGAGCTTCGGGACAGGGAGAGTGCGATGGGAACTACACCACAAAATCAGCCTACTCGGTCATTTTTGCGGGAGGTAACGATTCAGCGGCAGTCCAGAGACCCTCGGAGCTGAATGCGAGAGTGTGGAAAACGCCGGCGCCTCAGAAAACTATAGTCACGGCGTGGAGACTCCTTAAAAATAGACTTGCCACCTGTGACAACCTGGAAAAGAGGAAGGTGATGCTTGGCGATGAAGAGGTAAAGTGTAAATT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793295.1
MEDGASGQGECDGNYTTKSAYSVIFAGGNDSAAVQRPSELNARVWKTPAPQKTIVTAWRLLKNRLATCDNLEKRKVMLGDEEVKCKFCNSQKETIDHLFLLCPKTADLWDEIQKWLGFTTVRTNTARRHFESFAHLESGKKNRRFLLMVWVCSIWMVWRRRNECRFGNDVWDCKTILSEIKVRT

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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