当前解析结果
SmilChr02G004542| 统一新 Gene ID | SmilChr02G004542 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G004542 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr02G004542 |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 67988961 - 67989835 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131009916 |
|---|---|
| GeneID | 131009916 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131009916 |
| 原始查询 | LOC131009916 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131009916 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Chloroplast | 叶绿体 | 1.00000 | XP_057793299.1 |
| 2 | Chloroplast stroma | 叶绿体基质 | 0.20000 | XP_057793299.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057793299.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057793299.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057793299.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr2:67988982 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B140 |
Chr2:67989004 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B100,B119,B44 |
Chr2:67989009 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B81,C46,C53 |
Chr2:67989050 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B112,B31,B67,C3,C9 |
Chr2:67989078 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B56,B7 |
Chr2:67989086 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 14 | A15,A6,B105,B28,B30,B59,B7,B74,B81,B86,B89,C65,C67,C79 |
Chr2:67989106 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A6,B31,B67,C33,C9 |
Chr2:67989209 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B52 |
Chr2:67989210 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C29 |
Chr2:67989223 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B107,B140 |
Chr2:67989228 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B135,C58,C60 |
Chr2:67989263 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B88,C27,C55 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。