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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004858`

染色体: Chr02 坐标: 70719282-70720555 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004858`
名称	SmilChr02G004858
描述	uncharacterized SmilChr02G004858
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	70719282 - 70720555 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009943`
GeneID	`131009943`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009943`
原始查询	`LOC131009943`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0484800; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os06g0484800; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT1G43760` (AT1G43760) DNAse I-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840968] identity=27.3; qcov=0.905; evalue=1.77e-11; confidence=low
Rice	`Os06g0484800` - identity=28; qcov=0.835; evalue=1.58e-16; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009943

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057793325.1`
2	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057793325.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057793325.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793325.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057793325.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:70719364`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B40
`Chr2:70719427`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	13	A16,B12,B129,B130,B134,B45,B74,B95,C28,C70,D2,D7,D9
`Chr2:70719433`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B19
`Chr2:70719473`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B94
`Chr2:70719473`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B94
`Chr2:70719488`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr2:70719492`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B105,B65
`Chr2:70719496`	`CTA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	13	A16,B12,B129,B130,B134,B45,B74,B95,C28,C70,D2,D7,D9
`Chr2:70719499`	`A`	`ATG`	2bp_insertion	frameshift_variant	13	A16,B12,B129,B130,B134,B45,B74,B95,C28,C70,D2,D7,D9
`Chr2:70719502`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B105,B65
`Chr2:70719543`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B105,B65
`Chr2:70719563`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B105,B65

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937342.1
ATGTCCACATATCTGAAAACTGCATGCCTTGATATGGTGTGCGACGAGGAAAGTTTGGTTTTGATCCGTGTTCTCGTAGTATTGGGGTTATTATCCATGGTCATGACTCAGGCGGGATTCGGGATAGTCGAGGAGAATATTTCAAATCTGAAGAAGGAAATCCTCAAATGGGACTCCATTGATGATGTGTTCGGGTTGGAAGAGGAAGAGGCAGTTTTGAGATGTGAAGCGGAAGCAAATCTCCTTACTCAGTTGCAACA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009943
ATGTCCACATATCTGAAAACTGCATGCCTTGATATGGTGTGCGACGAGGAAAGTTTGGTTTTGATCCGTGTTCTCGTAGTATTGGGGTTATTATCCATGGTCATGACTCAGGCGGGATTCGGGATAGTCGAGGAGAATATTTCAAATCTGAAGAAGGAAATCCTCAAATGGGACTCCATTGATGATGTGTTCGGGTTGGAAGAGGAAGAGGCAGTTTTGAGATGTGAAGCGGAAGCAAATCTCCTTACTCAGTTGCAACA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793325.1
MSTYLKTACLDMVCDEESLVLIRVLVVLGLLSMVMTQAGFGIVEENISNLKKEILKWDSIDDVFGLEEEEAVLRCEAEANLLTQLQHRDSTLAQRACHRWLKDGDLNSSLFHKAINGRRARNNVSGLNVDGVWIQEPSEVKRIVKDHFHSQFRKRSRACLRLPADFVNRKISDSAREWLDRPFSEEEIKEAVWNCDGGKSPGPDGFNFLFMKRCWDVIKGDLLSVLREFHH

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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