当前解析结果
SmilChr02G005002| 统一新 Gene ID | SmilChr02G005002 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G005002 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr02G005002 |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 71821129 - 71821929 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131009953 |
|---|---|
| GeneID | 131009953 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131009953 |
| 原始查询 | LOC131009953 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131009953 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057793333.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.20000 | XP_057793333.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057793333.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057793333.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057793333.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr2:71821155 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B1,B44,C19 |
Chr2:71821190 |
C |
CT |
1bp_insertion | frameshift_variant | 40 | A10,A3,A8,B103,B11,B113,B115,B13,B130,B132,B133,B139,B30,B32,B36,B43,B45,B47,B50,B51,B53,B59,B66,B83,B88,B96,C13,C14,C25,C26,C27,C28,C29,C54,C60,C79,C80,C85,C86,D7 |
Chr2:71821191 |
T |
TA |
1bp_insertion | frameshift_variant | 1 | B129 |
Chr2:71821191 |
T |
TA |
1bp_insertion | CDS_variant | 1 | B129 |
Chr2:71821192 |
T |
TG |
1bp_insertion | frameshift_variant | 177 | A1,A10,A11,A13,A14,A15,A16,A18,A19,A2,A20,A21,A23,A25,A3,A4,A7,A9,B1,B10,B102,B103,B105,B106,B107,B108,B11,B110,B112,B113,B115,B117,B118,B12,B120,B122,B123,B125,B127,B128,B130,B131,B132,B133,B134,B137,B138,B139,B14,B140,B15,B16,B17,B18,B2,B21,B22,B24,B25,B29,B3,B30,B31,B36,B37,B38,B39,B40,B41,B45,B46,B48,B49,B5,B50,B51,B55,B58,B60,B65,B66,B67,B7,B71,B72,B73,B75,B76,B77,B78,B79,B80,B84,B85,B86,B87,B88,B90,B91,B92,B93,B94,B95,B97,B99,C10,C12,C13,C14,C15,C17,C18,C19,C2,C20,C21,C22,C24,C25,C26,C28,C29,C3,C30,C31,C32,C34,C35,C38,C39,C40,C43,C45,C46,C47,C48,C49,C5,C51,C52,C53,C55,C56,C58,C6,C60,C61,C62,C63,C64,C65,C66,C67,C68,C7,C70,C71,C72,C73,C74,C76,C77,C78,C79,C81,C82,C83,C84,C86,C87,C9,D11,D3,D4,D6,D7,D9 |
Chr2:71821193 |
G |
GA |
1bp_insertion | stop_gained,frameshift_variant | 2 | B113,B44 |
Chr2:71821193 |
G |
GA |
1bp_insertion | CDS_variant | 2 | B113,B44 |
Chr2:71821199 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 4 | B22,B33,B68,D4 |
Chr2:71821199 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B22,B33,B68,D4 |
Chr2:71821203 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B108 |
Chr2:71821217 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B44,C19,C45,C62,D3 |
Chr2:71821382 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C62 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。