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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G005027`

染色体: Chr02 坐标: 72013519-72015456 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G005027`
名称	SmilChr02G005027
描述	F-box protein VBF-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	72013519 - 72015456 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009954`
GeneID	`131009954`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009954`
原始查询	`LOC131009954`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	F-box protein VBF-like
产物	F-box protein VBF-like
Arabidopsis	`AT1G56250` (PP2-B14) phloem protein 2-B14 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842078] identity=42.1; qcov=0.832; evalue=5.05e-70; confidence=medium
Rice	`Os12g0131400` (OsFbox640) - identity=36.7; qcov=0.808; evalue=5.76e-52; confidence=medium
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF12937 (F-box-like); PF14299 (PP2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009954

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057793334.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057793334.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057793334.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793334.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057793334.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:72013735`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	C54,C74
`Chr2:72013735`	`C`	`CA`	1bp_insertion	CDS_variant	2	C54,C74
`Chr2:72013772`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B26
`Chr2:72013772`	`T`	`TA`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B26
`Chr2:72013801`	`TCC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	181	A1,A10,A11,A13,A14,A15,A16,A18,A19,A22,A23,A7,A8,A9,B1,B10,B101,B102,B103,B104,B107,B109,B11,B110,B112,B113,B114,B117,B119,B12,B122,B123,B124,B125,B126,B127,B128,B129,B130,B131,B132,B133,B135,B136,B137,B138,B139,B14,B15,B17,B19,B2,B20,B21,B23,B24,B25,B26,B27,B28,B29,B3,B31,B32,B33,B34,B35,B36,B40,B41,B42,B43,B44,B46,B48,B5,B50,B53,B54,B55,B57,B58,B6,B60,B61,B62,B63,B64,B65,B66,B67,B68,B69,B7,B71,B72,B73,B74,B76,B78,B79,B8,B81,B83,B87,B88,B89,B9,B93,B94,B95,B97,C10,C12,C14,C15,C16,C17,C2,C22,C23,C24,C25,C26,C28,C29,C3,C30,C31,C32,C35,C36,C37,C38,C39,C4,C42,C43,C44,C46,C47,C49,C5,C50,C51,C52,C53,C55,C56,C57,C59,C6,C61,C62,C63,C64,C65,C66,C67,C68,C7,C72,C74,C76,C77,C79,C8,C80,C81,C82,C83,C84,C85,C86,C87,D10,D2,D3,D4,D6,D7
`Chr2:72013945`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C85
`Chr2:72013986`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	3	B120,B47,B77
`Chr2:72013986`	`T`	`TG`	1bp_insertion	CDS_variant	3	B120,B47,B77
`Chr2:72014026`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C72
`Chr2:72014036`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B104,B118,C47,C8
`Chr2:72014057`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B11
`Chr2:72014057`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793334.1

334 aa

167

334

F-box-like

PP2

PF12937 F-box-like 66-108 aa PF14299 PP2 157-332 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793334.1`	Pfam	`PF12937`	F-box-like	Domain	66	108	8.3e-06	26.2	F-box-like
`XP_057793334.1`	Pfam	`PF14299`	PP2	Family	157	332	1.7e-41	142.4	Phloem protein 2

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937351.1
ATGGGGCACATAGTTTTCAAATACATATATATAAGCGTGGACCTTGAAAAGTCTTTGCATTTAACGCTACAAAAGATTAATACTCCATATAACAACCTCCTCACTCACATTACACACCAATTAAACCTCATTCATAAATCTTTGAATTTCTTCTTCTCCGATCCTCGCTCAGACAATATTAGAATGGCATGTTCATGGAGGCGGCTGCCGGAAGACTGCGTTTCGAGGATTTTGTCGGCCACGTCTCCGGCGGATGCATG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009954
ATGGGGCACATAGTTTTCAAATACATATATATAAGCGTGGACCTTGAAAAGTCTTTGCATTTAACGCTACAAAAGATTAATACTCCATATAACAACCTCCTCACTCACATTACACACCAATTAAACCTCATTCATAAATCTTTGAATTTCTTCTTCTCCGATCCTCGCTCAGACAATATTAGAATGGCATGTTCATGGAGGCGGCTGCCGGAAGACTGCGTTTCGAGGATTTTGTCGGCCACGTCTCCGGCGGATGCATG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793334.1
MGHIVFKYIYISVDLEKSLHLTLQKINTPYNNLLTHITHQLNLIHKSLNFFFSDPRSDNIRMACSWRRLPEDCVSRILSATSPADACRVLAVSKEFRHPADSNVVWDKFLPADAHRIVSSTPLNFSSTKELFFLLSNSILVDAGNKAFALERSTGRKSYILSARELSISDNDVDGNWTWKSIHESRFGEVAELKGAERVEMEGKIRSEILSPNTTYAAYLVFKISDDAYGLHSIPFETFIASGERVLATNTAALRDPPLQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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