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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G005080`

染色体: Chr02 坐标: 72430129-72430892 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G005080`
名称	SmilChr02G005080
描述	uncharacterized SmilChr02G005080
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	72430129 - 72430892 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009956`
GeneID	`131009956`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009956`
原始查询	`LOC131009956`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os02g0118800; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os02g0118800; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT2G02650` (AT2G02650) Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814794] identity=29.7; qcov=0.54; evalue=9.25e-08; confidence=low
Rice	`Os02g0118800` - identity=28.9; qcov=0.848; evalue=6.1e-11; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13966 (zf-RVT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009956

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057793335.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057793335.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793335.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057793335.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057793335.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:72430200`	`AGG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	B79,C45
`Chr2:72430200`	`AGG`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	2	B79,C45
`Chr2:72430201`	`G`	`GAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	B100,B68
`Chr2:72430201`	`G`	`GAT`	2bp_insertion	CDS_variant	2	B100,B68
`Chr2:72430203`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B100,B68
`Chr2:72430236`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D9
`Chr2:72430266`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B115,B140,B4,C45
`Chr2:72430273`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B115,B140,C45
`Chr2:72430274`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B62,B8,C52,D4
`Chr2:72430289`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	6	A1,B26,B36,B4,B72,B74
`Chr2:72430302`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B132,C3
`Chr2:72430346`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B17,B25,B58,C43,C73

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793335.1

237 aa

118

237

zf-RVT

PF13966 zf-RVT 45-138 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793335.1`	Pfam	`PF13966`	zf-RVT	Domain	45	138	5.5e-18	66.1	zinc-binding in reverse transcriptase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937352.1
ATGTGTTATAGAGCTGTTTTGAGGGATAGTGAGCAAGAACAGGTGCACCGGTTATCTGACCTTCTCAGCAACTATTGTCTTACAGCTGGGAAATCGGATGTTTGGAAGTGGAAAGCTACTTCGGATTTCACTTTCTCAGTCAAGTCGGCCTACAAGGCTATCTGTTTGATGGCGAATCCCACAAGCACTGGAAGGATGGAGAAGGAGATGTTGACTATCTGGAAAGCCCCAGCCCCCCTTAAGGCTGTTACCACAGCATG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009956
ATGTGTTATAGAGCTGTTTTGAGGGATAGTGAGCAAGAACAGGTGCACCGGTTATCTGACCTTCTCAGCAACTATTGTCTTACAGCTGGGAAATCGGATGTTTGGAAGTGGAAAGCTACTTCGGATTTCACTTTCTCAGTCAAGTCGGCCTACAAGGCTATCTGTTTGATGGCGAATCCCACAAGCACTGGAAGGATGGAGAAGGAGATGTTGACTATCTGGAAAGCCCCAGCCCCCCTTAAGGCTGTTACCACAGCATG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793335.1
MCYRAVLRDSEQEQVHRLSDLLSNYCLTAGKSDVWKWKATSDFTFSVKSAYKAICLMANPTSTGRMEKEMLTIWKAPAPLKAVTTAWKLFKGRLPTCDNLLKRQVPIQNSEALCVWCKLKEESIEHTFFTCQNSDDLWKKIILWLGQQTVLHCKVKDHYNAFTNLGKKEDQRFLRGVWICTTWVLWKERNECKFNQGKWNGEKLFAEIKSRLWGWKMTYKMSSSTSDFRNWFLAAFS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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