当前解析结果
SmilChr02G005109| 统一新 Gene ID | SmilChr02G005109 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G005109 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr02G005109 |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 72597857 - 72598841 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131009959 |
|---|---|
| GeneID | 131009959 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131009959 |
| 原始查询 | LOC131009959 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os06g0523701; species=rice; confidence=low |
| 产物 | hit=Os06g0523701; species=rice; confidence=low |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | Os06g0523701- identity=37.3; qcov=0.316; evalue=5.83e-09; confidence=low |
| GO | GO:0003676 (nucleic acid binding) |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131009959 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057793339.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057793339.1 |
| 3 | Telomere | 端粒 | 0.20000 | XP_057793339.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057793339.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057793339.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr2:72597992 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B43,B44 |
Chr2:72598034 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B98,C82 |
Chr2:72598051 |
T |
TA |
1bp_insertion | frameshift_variant | 2 | B11,B87 |
Chr2:72598051 |
T |
TA |
1bp_insertion | CDS_variant | 2 | B11,B87 |
Chr2:72598128 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B35 |
Chr2:72598365 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B2,B75 |
Chr2:72598374 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B97,C37,C40,D8 |
Chr2:72598450 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B103 |
Chr2:72598459 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D7 |
Chr2:72598472 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C35 |
Chr2:72598569 |
T |
TG |
1bp_insertion | frameshift_variant | 16 | B104,B117,B41,B42,B47,B58,B78,B88,B89,B91,B96,C26,C27,C33,C46,D5 |
Chr2:72598574 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B136,C71 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。