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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G005137`

染色体: Chr02 坐标: 72808008-72808742 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G005137`
名称	SmilChr02G005137
描述	uncharacterized SmilChr02G005137
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	72808008 - 72808742 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009962`
GeneID	`131009962`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009962`
原始查询	`LOC131009962`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	DUF1685 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818876]; symbol=AT2G42760; hit=AT2G42760; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	DUF1685 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818876]; symbol=AT2G42760; hit=AT2G42760; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT2G42760` (AT2G42760) DUF1685 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818876] identity=43.9; qcov=0.766; evalue=5.58e-33; confidence=medium
Rice	`Os06g0550800` - identity=43.8; qcov=0.561; evalue=8.31e-22; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF07939 (DUF1685)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009962

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057793341.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057793341.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057793341.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793341.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057793341.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:72808066`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B16,B55,C47,C51
`Chr2:72808076`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B113,B86
`Chr2:72808098`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	11	A14,B113,B125,B17,B39,B48,B86,B97,C72,C76,D1
`Chr2:72808110`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B4
`Chr2:72808110`	`CA`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B4
`Chr2:72808196`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B22,B36,B65,B84
`Chr2:72808226`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B22,B36,B65,B84,B90
`Chr2:72808329`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B118,C78
`Chr2:72808344`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A21,C28
`Chr2:72808393`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B13,B43
`Chr2:72808546`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B125,B90,B92,C21,C73
`Chr2:72808583`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A18,B128,B69,B95

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793341.1

244 aa

122

244

DUF1685

PF07939 DUF1685 139-168 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793341.1`	Pfam	`PF07939`	DUF1685	Family	139	168	1.1e-05	25.8	Protein of unknown function (DUF1685)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937358.1
ATGTCAGCTGAAGAAACAGTGTTAAACCTGTTCGAAACGTACTGGTTCGAGCAGAGAGCCTTTGCGCCGAAAACGGCGCCGTTTTTTCCACAGGAAAAATCTCAAGAATCTGCTGCTGCCGTTGAGCCGAATCTGAACCGGATCACAACCCTAATGAGAAAATCGTACAGCGATCACAATCTCGGCTCCGAATTAGACCTCGCGAGCTCTCCGTCGCCGACGTCAGTCCTCGGCCCCCATCTTCAGACAATTCTCTCCGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009962
ATGTCAGCTGAAGAAACAGTGTTAAACCTGTTCGAAACGTACTGGTTCGAGCAGAGAGCCTTTGCGCCGAAAACGGCGCCGTTTTTTCCACAGGAAAAATCTCAAGAATCTGCTGCTGCCGTTGAGCCGAATCTGAACCGGATCACAACCCTAATGAGAAAATCGTACAGCGATCACAATCTCGGCTCCGAATTAGACCTCGCGAGCTCTCCGTCGCCGACGTCAGTCCTCGGCCCCCATCTTCAGACAATTCTCTCCGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793341.1
MSAEETVLNLFETYWFEQRAFAPKTAPFFPQEKSQESAAAVEPNLNRITTLMRKSYSDHNLGSELDLASSPSPTSVLGPHLQTILSGKEVESFDESSAPELEHIKIGETKLDPKSDKVRERRRGRRKSGASRSLSELEVEELKGFMDLGFVFSDEDKDSRLVSIIPGLQRLGKESESVIGGFDETTASASVSRPYLSEAWDRMEEEERLVKNPLMDWRIPAFDNEMELKDHLKFWAHSVASTVR

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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