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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G005148`

染色体: Chr02 坐标: 72873195-72873635 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G005148`
名称	SmilChr02G005148
描述	protein AGENET DOMAIN (AGD)-CONTAINING P1-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	72873195 - 72873635 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009965`
GeneID	`131009965`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009965`
原始查询	`LOC131009965`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein AGENET DOMAIN (AGD)-CONTAINING P1-like
产物	protein AGENET DOMAIN (AGD)-CONTAINING P1-like
Arabidopsis	`AT1G06340` (AT1G06340) Plant Tudor-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837145] identity=46.5; qcov=0.884; evalue=3.26e-33; confidence=medium
Rice	`Os05g0132400` - identity=37.7; qcov=0.945; evalue=2.17e-23; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF05641 (Agenet)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009965

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057793344.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793344.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057793344.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057793344.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057793344.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:72873214`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	7	A3,A7,B111,B133,B37,C45,C66
`Chr2:72873258`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B104
`Chr2:72873258`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr2:72873285`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A20,B106,C30
`Chr2:72873300`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A20,B106,C30
`Chr2:72873346`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A20,A8,B67
`Chr2:72873348`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B2,B68,C72
`Chr2:72873354`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B60
`Chr2:72873420`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr2:72873423`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B44,B74,B81,C43,C65
`Chr2:72873455`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C2,D7
`Chr2:72873558`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B63,B67,C48

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793344.1

146 aa

146

Agenet

PF05641 Agenet 8-68 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793344.1`	Pfam	`PF05641`	Agenet	Domain	8	68	2.4e-20	73.5	Agenet domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937361.1
ATGGCGCGGCGGTTCCGGCGCGGCGATGCGGTGGAGGTGGCGAGCGTGCAGGAAGGATTTGTTGGTTCCTACTACGAGGCCACCGTCATGACCGATCTCTCAAAACACGGCTACTACGTGCAGTATCGCACTCTGCTCAAGGACGATCTCTCGGGCCCGCTGCGTGAGGTGGCCTCCGCCGCCGAGGTCCGCCCCAGGCCGCCGCCCGATCCGGCGACGGAGTACCGGCTGCACGACGTGGTGGACGCGTTCGACAACGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009965
ATGGCGCGGCGGTTCCGGCGCGGCGATGCGGTGGAGGTGGCGAGCGTGCAGGAAGGATTTGTTGGTTCCTACTACGAGGCCACCGTCATGACCGATCTCTCAAAACACGGCTACTACGTGCAGTATCGCACTCTGCTCAAGGACGATCTCTCGGGCCCGCTGCGTGAGGTGGCCTCCGCCGCCGAGGTCCGCCCCAGGCCGCCGCCCGATCCGGCGACGGAGTACCGGCTGCACGACGTGGTGGACGCGTTCGACAACGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793344.1
MARRFRRGDAVEVASVQEGFVGSYYEATVMTDLSKHGYYVQYRTLLKDDLSGPLREVASAAEVRPRPPPDPATEYRLHDVVDAFDNDGWWWGRITGRSGDGYTVFFETTGDEIFYHKSRLRTHQEWSNGTWCLAELIPIEDYHHVS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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