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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G005192`

染色体: Chr02 坐标: 73202568-73203346 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G005192`
名称	SmilChr02G005192
描述	probable O-methyltransferase 3
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	73202568 - 73203346 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009968`
GeneID	`131009968`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009968`
原始查询	`LOC131009968`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable O-methyltransferase 3
产物	probable O-methyltransferase 3
Arabidopsis	`AT4G35160` (AT4G35160) O-methyltransferase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829668] identity=31.6; qcov=0.905; evalue=1.97e-08; confidence=low
Rice	`Os08g0169300` - identity=45.5; qcov=0.962; evalue=2.37e-20; confidence=low
GO	GO:0008171 (O-methyltransferase activity); GO:0008757 (S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase activity); GO:0019438 (GO:0019438); GO:0032259 (methylation)
KEGG	-
Pfam	PF00891 (Methyltransf_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009968

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057793347.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057793347.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057793347.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793347.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057793347.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:73202571`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C37
`Chr2:73202571`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C37
`Chr2:73202573`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr2:73203046`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B17,B74
`Chr2:73203047`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,B118,B26
`Chr2:73203078`	`A`	`AGT`	2bp_insertion	frameshift_variant	20	B1,B110,B111,B119,B138,B31,B55,B76,B90,B92,C14,C17,C21,C23,C28,C48,C58,C73,C81,D10
`Chr2:73203157`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C37
`Chr2:73203198`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B22,B24,B76,C33
`Chr2:73203204`	`A`	`ATC`	2bp_insertion	frameshift_variant	19	B1,B110,B111,B119,B138,B31,B55,B90,B92,C14,C17,C21,C23,C28,C48,C58,C73,C81,D10
`Chr2:73203218`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C72
`Chr2:73203249`	`AAG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	6	B22,B24,B76,C33,C37,D11
`Chr2:73203319`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B93

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793347.1

105 aa

105

Methyltransf_2

PF00891 Methyltransf_2 8-91 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793347.1`	Pfam	`PF00891`	Methyltransf_2	Domain	8	91	5.9e-13	49.4	O-methyltransferase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937364.1
ATGCAGCCCCTTCTGCGCGACTCCGTTCTGCTCGACTGGCACGACGAAGACAGTGTGAAAATACTGAAGAAATGCAGAGAAGCAATAGGCAGCAGCAGCAATGAGAGTGCCGGGAAGGTGATGATCATCGACATCGTTTTGAACAACCATGGAGGTGCCAATATGGCGACGAAAGAACAACTCCTCTACGACGCCGCGATGTTTACGTATCTCAACGGAAAAGTAGGCGACGAGAAAGAATGGGCATCGATGTTCGCTGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009968
ATGCAGCCCCTTCTGCGCGACTCCGTTCTGCTCGACTGGCACGACGAAGACAGTGTGAAAATACTGAAGAAATGCAGAGAAGCAATAGGCAGCAGCAGCAATGAGAGTGCCGGGAAGGTGATGATCATCGACATCGTTTTGAACAACCATGGAGGTGCCAATATGGCGACGAAAGAACAACTCCTCTACGACGCCGCGATGTTTACGTATCTCAACGGAAAAGTAGGCGACGAGAAAGAATGGGCATCGATGTTCGCTGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793347.1
MQPLLRDSVLLDWHDEDSVKILKKCREAIGSSSNESAGKVMIIDIVLNNHGGANMATKEQLLYDAAMFTYLNGKVGDEKEWASMFADAGFSSYNITLSEVYPLLV

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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