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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID,以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因,再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。
示例

当前解析结果

SmilChr02G005324

染色体: Chr02 坐标: 74115957-74117456 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene IDSmilChr02G005324
名称SmilChr02G005324
描述uncharacterized SmilChr02G005324
染色体 / SeqIDChr02 / NC_080388.1
坐标与链方向74115957 - 74117456 / +

ID 对照

NCBI Gene IDLOC131009986
GeneID131009986
locus_tag-
NCBI NameLOC131009986
原始查询LOC131009986

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述hit=Os01g0595300; species=rice; confidence=low
产物hit=Os01g0595300; species=rice; confidence=low
ArabidopsisAT1G06740 (MUG3)
MuDR family transposase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3766669]
identity=22.3; qcov=0.791; evalue=1.71e-12; confidence=weak
RiceOs01g0595300
-
identity=25.2; qcov=0.765; evalue=3.03e-16; confidence=low
GO-
KEGG-
PfamPF00872 (Transposase_mut); PF10551 (MULE)
InterPro-
eggNOG-
NRGeneID:131009986

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank定位位置中文ScoreProtein ID
1 Nucleus 细胞核 1.00000 XP_057793364.1
2 Chromosome 染色体 0.00000 XP_057793364.1
3 Centromere 着丝粒 0.00000 XP_057793364.1
4 Chromatin 染色质 0.00000 XP_057793364.1
5 Telomere 端粒 0.00000 XP_057793364.1

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

该基因暂未检索到已上线的精选 EMS CDS / LoF 突变,或 EMS 突变库仍在构建。

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793364.1
358 aa
N
1
179
358
MULE
Transposase_mut
C
PF10551 MULE 272-346 aa PF00872 Transposase_mut 272-348 aa
Protein ID 来源 结构域编号 结构域名称 类型 起始 aa 终止 aa E-value Score 说明
XP_057793364.1 Pfam PF10551 MULE Domain 272 346 8.8e-13 49.2 MULE transposase domain
XP_057793364.1 Pfam PF00872 Transposase_mut Family 272 348 4.7e-08 33.0 Transposase, Mutator family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA(仅基因区域)

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA
XM_057937381.1
ATGTTGTTGAAGACGATTACAGTGGAGGAGTGTATGTTCCTTCGTTCGATCTCCCTCAATCTTCCGGCCGGAGATTCACCGGCGCAACAAAGTGTTGAACCGTCGGTCACTTGGGGTAATGATCAGTCAACGGGTTGGCCTTCATGGGATGAGCCAAATCCGTACCAGTACGATCGCCTAATAATTGATCGTTGTTGGGGTCCAGCTGATGATCAATATACGTACGAGCCTCAGTTTGTGGAGGATGCTGGTAATGTAGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA
LOC131009986
ATGTTGTTGAAGACGATTACAGTGGAGGAGTGTATGTTCCTTCGTTCGATCTCCCTCAATCTTCCGGCCGGAGATTCACCGGCGCAACAAAGTGTTGAACCGTCGGTCACTTGGGGTAATGATCAGTCAACGGGTTGGCCTTCATGGGATGAGCCAAATCCGTACCAGTACGATCGCCTAATAATTGATCGTTGTTGGGGTCCAGCTGATGATCAATATACGTACGAGCCTCAGTTTGTGGAGGATGCTGGTAATGTAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA
XP_057793364.1
MLLKTITVEECMFLRSISLNLPAGDSPAQQSVEPSVTWGNDQSTGWPSWDEPNPYQYDRLIIDRCWGPADDQYTYEPQFVEDAGNVDEDYVPSSEAETDTSASEDLSETENVRRAGIEYAGWQNLQIDEDDDEQGKEFSVSKSDSRRVYFKCKHSDTCPFKLHASSQDGVIWGVYKFTNEHSCDGELGRVARIKAPAKVVAAYLAQKIHDDCEILKPKAIQLELRREFGVQIKYDVALRARNRATEMVYGRHDQSFEMLP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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