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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G005380`

染色体: Chr02 坐标: 74478315-74480535 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G005380`
名称	SmilChr02G005380
描述	uncharacterized SmilChr02G005380
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	74478315 - 74480535 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009992`
GeneID	`131009992`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009992`
原始查询	`LOC131009992`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	AT5G43240; symbol=AT5G43240; hit=AT5G43240; species=arabidopsis; confidence=low
产物	AT5G43240; symbol=AT5G43240; hit=AT5G43240; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT5G43240` (AT5G43240) - identity=29.6; qcov=1.05; evalue=1.69e-36; confidence=low
Rice	`Os04g0594500` - identity=27.3; qcov=0.762; evalue=4.41e-31; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF05056 (DUF674)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009992

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057793369.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793369.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057793369.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057793369.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057793369.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:74478318`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B28
`Chr2:74478349`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	11	A18,A4,A6,B1,B56,B7,B77,B93,C49,C60,C85
`Chr2:74478352`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	92	A11,A18,A3,A4,A6,A8,B1,B100,B101,B102,B112,B117,B119,B12,B123,B126,B127,B128,B13,B130,B135,B136,B138,B14,B140,B16,B25,B29,B3,B30,B31,B34,B39,B48,B5,B52,B54,B55,B56,B57,B63,B66,B7,B73,B74,B77,B81,B82,B86,B9,B90,B92,B93,B99,C11,C15,C19,C20,C21,C22,C23,C26,C27,C3,C34,C38,C4,C41,C45,C46,C49,C5,C55,C57,C58,C59,C6,C60,C64,C66,C69,C71,C74,C75,C79,C80,C81,C85,C9,D10,D5,D6
`Chr2:74478358`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	8	A18,A4,A6,B1,B56,B93,C49,C85
`Chr2:74478376`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	6	A22,B103,B27,C44,C62,C73
`Chr2:74478521`	`CCA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	5	B41,B76,C25,C31,D7
`Chr2:74478521`	`CCA`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	5	B41,B76,C25,C31,D7
`Chr2:74478525`	`A`	`AGT`	2bp_insertion	frameshift_variant	5	B41,B76,C25,C31,D7
`Chr2:74478525`	`A`	`AGT`	2bp_insertion	CDS_variant	5	B41,B76,C25,C31,D7
`Chr2:74478527`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	92	A14,A16,A18,A19,A2,A22,A25,A4,A6,A7,B100,B101,B105,B106,B11,B113,B114,B115,B118,B120,B121,B124,B128,B129,B131,B15,B20,B26,B30,B35,B37,B38,B39,B40,B42,B45,B51,B52,B53,B56,B58,B60,B62,B65,B66,B68,B7,B75,B79,B8,B80,B87,B89,B90,B92,B94,B96,B98,B99,C17,C19,C24,C30,C34,C37,C41,C43,C47,C49,C5,C51,C52,C54,C55,C57,C58,C60,C61,C65,C67,C73,C74,C76,C77,C8,C84,C85,C86,C87,D3,D7,D8
`Chr2:74478531`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B41,B76,C25,C31,D7
`Chr2:74478533`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	91	A14,A16,A18,A19,A2,A22,A25,A4,A6,A7,B100,B101,B106,B11,B113,B114,B115,B118,B120,B121,B124,B128,B129,B131,B15,B20,B26,B30,B35,B37,B38,B39,B40,B42,B45,B51,B52,B53,B56,B58,B60,B62,B65,B66,B68,B7,B75,B79,B8,B80,B87,B89,B90,B92,B94,B96,B98,B99,C17,C19,C24,C30,C34,C37,C41,C43,C47,C49,C5,C51,C52,C54,C55,C57,C58,C60,C61,C65,C67,C73,C74,C76,C77,C8,C84,C85,C86,C87,D3,D7,D8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793369.1

471 aa

236

471

DUF674

PF05056 DUF674 3-430 aa PF05056 DUF674 382-461 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793369.1`	Pfam	`PF05056`	DUF674	Family	3	430	6.8e-86	289.6	Protein of unknown function (DUF674)
`XP_057793369.1`	Pfam	`PF05056`	DUF674	Family	382	461	6.8e-86	289.6	Protein of unknown function (DUF674)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937386.1
ATGGTTACGCTGCCTCTTAAAGTAATGGTCGACAAAGATAATACAAAGGTGTTATTCGCGGAAGCCAACAGCGATTTCGTAAACGTTTTGTTAAGCTTCCTCGCGTTGCCTTTGGGCATATTTGCGAGAAAATTCTATGTAAAAAGCCTATACACTTTATACAGAGGTTTATACAATATGGATGAATCCTACTTTAGCGTTCGAGGCGCTAAGGAGATGCTGCAAAATCCACGAAGTTGTTTCAGAGCTGAATGCCGCAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009992
ATGGTTACGCTGCCTCTTAAAGTAATGGTCGACAAAGATAATACAAAGGTGTTATTCGCGGAAGCCAACAGCGATTTCGTAAACGTTTTGTTAAGCTTCCTCGCGTTGCCTTTGGGCATATTTGCGAGAAAATTCTATGTAAAAAGCCTATACACTTTATACAGAGGTTTATACAATATGGATGAATCCTACTTTAGCGTTCGAGGCGCTAAGGAGATGCTGCAAAATCCACGAAGTTGTTTCAGAGCTGAATGCCGCAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793369.1
MVTLPLKVMVDKDNTKVLFAEANSDFVNVLLSFLALPLGIFARKFYVKSLYTLYRGLYNMDESYFSVRGAKEMLQNPRSCFRAECRKLVLDITGSLPNDFYVCSDKECPKTEAYKNVSMYSDIATCACGRSLSRKISVGESVDGAFVTNPSSFIVTGDLRVVPILSGLFQTLSNLGIAVTQGASMRSMSFYIDEIEKLFELCLTSATPLDDMIFKKTGLSSTVSTAAKPEPGINLLRHIPKDKAHSREIVLKVFLQESTN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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