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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G005381`

染色体: Chr02 坐标: 74482196-74486036 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G005381`
名称	SmilChr02G005381
描述	uncharacterized SmilChr02G005381
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	74482196 - 74486036 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009993`
GeneID	`131009993`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009993`
原始查询	`LOC131009993`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	AT3G09110; symbol=AT3G09110; hit=AT3G09110; species=arabidopsis; confidence=low
产物	AT3G09110; symbol=AT3G09110; hit=AT3G09110; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G09110` (AT3G09110) - identity=31.8; qcov=0.537; evalue=5.1e-38; confidence=low
Rice	`Os04g0594500` - identity=27.1; qcov=0.673; evalue=6.06e-36; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF05056 (DUF674)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009993

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057793371.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057793371.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057793371.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793371.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057793371.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:74482208`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	33	A1,A24,A25,A4,B124,B129,B136,B15,B26,B35,B44,B45,B50,B7,B74,B78,B8,B89,B96,C10,C13,C16,C17,C23,C24,C30,C34,C42,C43,C60,C70,D3,D7
`Chr2:74482212`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	33	A1,A24,A25,A4,B124,B129,B136,B15,B26,B35,B44,B45,B50,B7,B74,B78,B8,B89,B96,C10,C13,C16,C17,C23,C24,C30,C34,C42,C43,C60,C70,D3,D7
`Chr2:74482213`	`TGC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	9	B1,B27,B46,B54,B70,C39,C62,C72,C73
`Chr2:74482240`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B33,C80
`Chr2:74482293`	`ACG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	6	A5,B108,B78,C39,C72,C73
`Chr2:74482348`	`TCC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	14	A5,B1,B108,B27,B36,B46,B54,B70,B78,C39,C62,C72,C73,C78
`Chr2:74482395`	`ACC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C25
`Chr2:74482395`	`ACC`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C25
`Chr2:74482409`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	58	A13,A14,A2,B103,B104,B113,B118,B119,B121,B127,B128,B131,B20,B37,B38,B39,B41,B49,B53,B59,B60,B62,B68,B70,B75,B77,B79,B87,B94,B99,C10,C19,C2,C20,C25,C28,C32,C35,C38,C39,C46,C5,C51,C52,C57,C58,C60,C61,C65,C67,C68,C72,C73,C78,C79,C86,D10,D7
`Chr2:74482411`	`TAC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	58	A13,A14,A15,A2,B103,B104,B113,B118,B119,B121,B127,B128,B131,B20,B37,B38,B39,B41,B49,B53,B59,B60,B62,B68,B70,B75,B77,B79,B87,B94,B99,C10,C19,C2,C20,C25,C28,C32,C35,C38,C39,C46,C5,C51,C52,C57,C58,C60,C61,C65,C67,C68,C72,C73,C79,C86,D10,D7
`Chr2:74482415`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	A15
`Chr2:74482415`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A15

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793371.1

538 aa

269

538

DUF674

PF05056 DUF674 7-354 aa PF05056 DUF674 361-452 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793371.1`	Pfam	`PF05056`	DUF674	Family	7	354	8.2e-89	299.2	Protein of unknown function (DUF674)
`XP_057793371.1`	Pfam	`PF05056`	DUF674	Family	361	452	8.2e-89	299.2	Protein of unknown function (DUF674)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937388.1
ATGTCATACAACACCTATGCAAAGCTGCCTCTCAAAGTTATGATCAACAAACAGAAATCCAAGGTCCTCTTTGCAGAAGCCAACAGTGATTTCATCAACGTCTTGTTAAGCTTTTTGGCGATGCCTTTGGGGAAAATCGTGGAAAACTACATTCCACTAGGAAGCTTGAACACTTTGAACTCATCTTTAAGTAATCTCGACCAATCCTATTTCTCTACGCGAGGCGCAAAGCAGATGCTGCTGAATCCACAAAGTTCGTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009993
ATGTCATACAACACCTATGCAAAGCTGCCTCTCAAAGTTATGATCAACAAACAGAAATCCAAGGTCCTCTTTGCAGAAGCCAACAGTGATTTCATCAACGTCTTGTTAAGCTTTTTGGCGATGCCTTTGGGGAAAATCGTGGAAAACTACATTCCACTAGGAAGCTTGAACACTTTGAACTCATCTTTAAGTAATCTCGACCAATCCTATTTCTCTACGCGAGGCGCAAAGCAGATGCTGCTGAATCCACAAAGTTCGTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793371.1
MSYNTYAKLPLKVMINKQKSKVLFAEANSDFINVLLSFLAMPLGKIVENYIPLGSLNTLNSSLSNLDQSYFSTRGAKQMLLNPQSSFRAECRKLAIDITASNPSRYFVCEDGDCTKSGFRNVSMYSDIATCECGKSLNRSVSVEERLDVGVFTISPLSFVVTDDLRVAPIVSGVIQTLNSLGITETEGAELMRLSFDADEIKKLLNLCLTSTTPFTDMIFAKTGVISTAAKPEPGILLHHIQKSDANPRKMALKICLQKS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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