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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G005387`

染色体: Chr02 坐标: 74514699-74516819 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G005387`
名称	SmilChr02G005387
描述	uncharacterized SmilChr02G005387
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	74514699 - 74516819 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009996`
GeneID	`131009996`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009996`
原始查询	`LOC131009996`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	AT5G01140; symbol=AT5G01140; hit=AT5G01140; species=arabidopsis; confidence=low
产物	AT5G01140; symbol=AT5G01140; hit=AT5G01140; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT5G01140` (AT5G01140) - identity=28; qcov=1.06; evalue=9.08e-23; confidence=low
Rice	`Os01g0153500` - identity=30.4; qcov=0.789; evalue=2.24e-20; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF05056 (DUF674)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009996

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057793374.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057793374.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057793374.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793374.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057793374.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:74514966`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A5,B108,C78
`Chr2:74515299`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B44,C79
`Chr2:74515380`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B136
`Chr2:74515396`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B93
`Chr2:74515396`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B93
`Chr2:74515398`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C55
`Chr2:74515475`	`T`	`TGC`	2bp_insertion	frameshift_variant	27	A11,A18,A25,B106,B125,B129,B134,B138,B22,B3,B31,B37,B4,B44,B54,B59,B6,B70,B79,B81,B91,C35,C53,C56,C63,D1,D11
`Chr2:74515486`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	62	A11,A15,A18,A19,A25,A9,B1,B10,B106,B117,B124,B125,B129,B13,B134,B136,B138,B21,B22,B31,B33,B37,B4,B42,B43,B44,B46,B54,B59,B6,B79,B8,B81,B82,B9,B91,B99,C17,C18,C2,C21,C29,C34,C35,C36,C38,C4,C41,C43,C46,C49,C53,C56,C58,C62,C63,C79,C80,C81,D1,D10,D11
`Chr2:74515581`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7
`Chr2:74515616`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A13,C1,C11
`Chr2:74515788`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C79,D7
`Chr2:74515852`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B13,B33,C80

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793374.1

313 aa

156

313

DUF674

PF05056 DUF674 16-278 aa PF05056 DUF674 241-304 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793374.1`	Pfam	`PF05056`	DUF674	Family	16	278	7.3e-53	180.7	Protein of unknown function (DUF674)
`XP_057793374.1`	Pfam	`PF05056`	DUF674	Family	241	304	7.3e-53	180.7	Protein of unknown function (DUF674)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937391.1
ATGAAAAGAGAAGTAGCTAAAAGCGATGCTCAAATTGCCCCTTTTTGTGATGGAGTTTTCACAAGGGCGACGGCGTCGTTTCTGGTTACAGATGATCTGCAGATACTCCCTAATGCTGGGCTCTTGCAAATTGTCAGTGTTCTTGGTGTTGCAGACTTGGATGAGGCTGAGACTATCAACGTTACCTTTGGATTATTTGATGTCTTGGAGTTGCTCGAGGCATCGTTGATTTGCACGAATCCATTGTCCGTCGTCATACT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009996
ATGAAAAGAGAAGTAGCTAAAAGCGATGCTCAAATTGCCCCTTTTTGTGATGGAGTTTTCACAAGGGCGACGGCGTCGTTTCTGGTTACAGATGATCTGCAGATACTCCCTAATGCTGGGCTCTTGCAAATTGTCAGTGTTCTTGGTGTTGCAGACTTGGATGAGGCTGAGACTATCAACGTTACCTTTGGATTATTTGATGTCTTGGAGTTGCTCGAGGCATCGTTGATTTGCACGAATCCATTGTCCGTCGTCATACT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793374.1
MKREVAKSDAQIAPFCDGVFTRATASFLVTDDLQILPNAGLLQIVSVLGVADLDEAETINVTFGLFDVLELLEASLICTNPLSVVILHEGGEYEEQSPSPAANASISNSKTMNLKLMVQKSTNKLLYAEAEEDFVEFLFSFLVIPLGRVVSLLSRNSNLKPIDSLYKSADDLIHHKYFINFDAKNRLIQPNIPHGYISNDHIFPLTEESLPDAYSSSYSWFPSAMLPKRKVSYLIGPRTYKVSDDLTVTPFCIVSILSSL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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