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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G005393`

染色体: Chr02 坐标: 74535387-74537827 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G005393`
名称	SmilChr02G005393
描述	uncharacterized protein At2g39795, mitochondrial-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	74535387 - 74537827 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009999`
GeneID	`131009999`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009999`
原始查询	`LOC131009999`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Mitochondrial glycoprotein family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831729]; symbol=AT5G02050; hit=AT5G02050; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	Mitochondrial glycoprotein family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831729]; symbol=AT5G02050; hit=AT5G02050; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT5G02050` (AT5G02050) Mitochondrial glycoprotein family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831729] identity=36.5; qcov=1.01; evalue=1.57e-37; confidence=medium
Rice	`Os01g0143300` - identity=42; qcov=0.758; evalue=5.2e-35; confidence=medium
GO	GO:0005759 (mitochondrial matrix)
KEGG	-
Pfam	PF02330 (MAM33)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009999

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057793377.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057793377.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793377.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057793377.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057793377.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:74535525`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C25,C43
`Chr2:74535666`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr2:74535683`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B49
`Chr2:74536645`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B129,B30,B69,C19
`Chr2:74536675`	`TC`	`*`	1bp_deletion	CDS_variant	4	A18,A20,B22,C63
`Chr2:74536700`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A18,A20,B20,B22,C63
`Chr2:74536755`	`TCG`	`*`	2bp_deletion	CDS_variant	4	B2,B20,B42,C14
`Chr2:74536872`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A6,B17,B74,C73,C81
`Chr2:74536875`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A6,B17,B74,C73,C81
`Chr2:74537614`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A10,B80,B98
`Chr2:74537753`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A24,A9,C19

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793377.1

264 aa

132

264

MAM33

PF02330 MAM33 77-217 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793377.1`	Pfam	`PF02330`	MAM33	Domain	77	217	5.1e-26	92.6	Mitochondrial glycoprotein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937394.1
ACTGCAAAAACAATATGACGCCTCTCCTTCTCTCACTTCACAAAATCCTCATTTCTCCTTCTCTCTCCATCTCCACGAAAAATGGTCCTAAACAGCGTGATACGCAGAGCTTCGAGAGTCGTACCTTTGGCCATTAGGGCTTCCGCCGGAAGTCAGAGGTACCTGCACAACCACCATCATGGCGCAGCCGTTCGCGCCGCCGTCAATCAAACTTCACGCAATTTCTTTCCGAGGGTATTTCACCACTACTCCACCAAGCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009999
ATGGTCCTAAACAGCGTGATACGCAGAGCTTCGAGAGTCGTACCTTTGGCCATTAGGGCTTCCGCCGGAAGTCAGAGGTACCTGCACAACCACCATCATGGCGCAGCCGTTCGCGCCGCCGTCAATCAAACTTCACGCAATTTCTTTCCGAGGGTATTTCACCACTACTCCACCAAGCCCAAATCGGACGAGTTGCTCCTCCGAGTTCTCAAGTCCGAGATTATCGAGACTCAGACTGAAGAAGAGATCGAGATTCCCGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793377.1
MVLNSVIRRASRVVPLAIRASAGSQRYLHNHHHGAAVRAAVNQTSRNFFPRVFHHYSTKPKSDELLLRVLKSEIIETQTEEEIEIPESFPFHIIDVPCPKETITLVREYNRENISVEVQIPDVGIPDEDDRQITQYCLPMLIKVSKPNSPSLEFSCGAYFDGTTIDSMSIKDPEVSEDQIAYEGPDFGDLDENLQKAFHKYLEIRGITPTVTALLCNHINLDQDCVERWVKEDLHLMFDPEPIDVEDVCLSPSGITFYGN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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