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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G005394`

染色体: Chr02 坐标: 74538795-74540333 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G005394`
名称	SmilChr02G005394
描述	uncharacterized SmilChr02G005394
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	74538795 - 74540333 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010001`
GeneID	`131010001`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010001`
原始查询	`LOC131010001`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	AT3G09110; symbol=AT3G09110; hit=AT3G09110; species=arabidopsis; confidence=low
产物	AT3G09110; symbol=AT3G09110; hit=AT3G09110; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G09110` (AT3G09110) - identity=33.8; qcov=0.728; evalue=2.59e-52; confidence=low
Rice	`Os04g0594500` - identity=29; qcov=0.737; evalue=1.21e-39; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF05056 (DUF674)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010001

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057793378.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057793378.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793378.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057793378.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057793378.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:74538830`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	5	A14,B64,B92,C66,C71
`Chr2:74538830`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A14,B64,B92,C66,C71
`Chr2:74538857`	`TGG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	8	B45,B83,B84,B89,B93,C14,C18,C81
`Chr2:74538860`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	8	B45,B83,B84,B89,B93,C14,C18,C81
`Chr2:74538994`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr2:74539104`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	29	A18,A5,B1,B103,B105,B112,B125,B137,B20,B29,B44,B48,B53,B54,B64,B81,B90,C35,C40,C47,C49,C56,C69,C72,C78,C81,C82,C85,D9
`Chr2:74539161`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B125,B51,B84,C22,C81
`Chr2:74539163`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B125,B51,B84,C22,C81
`Chr2:74539227`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B130,D11
`Chr2:74539348`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A4,B11,B52
`Chr2:74539408`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B65
`Chr2:74539434`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B65,B75

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793378.1

463 aa

232

463

DUF674

PF05056 DUF674 8-428 aa PF05056 DUF674 380-456 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793378.1`	Pfam	`PF05056`	DUF674	Family	8	428	3.9e-105	353.0	Protein of unknown function (DUF674)
`XP_057793378.1`	Pfam	`PF05056`	DUF674	Family	380	456	3.9e-105	353.0	Protein of unknown function (DUF674)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937395.1
ATGTCTCATGCTGGTAAGGATATTAAGTTTTCATTGAAAGTTATGGTGAATAAAAAGAAAGGGAAGGTTCTATTTGCAGAAGTTGACAGCAGCTTTGCAGATGTGTTGCTAAGCTTTCTCACATTGCCACTCGGAACGATCGTGAGAATCTTGAAGAAGCACTACGGAGACGATGCACCCGCCTTTGGAAGCTTGAGCACTCTCTACAACGGTTTAGCAAATCTTGATAGTGACCATTTTTGGACAGAAGGTGCTAAGTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131010001
ATGTCTCATGCTGGTAAGGATATTAAGTTTTCATTGAAAGTTATGGTGAATAAAAAGAAAGGGAAGGTTCTATTTGCAGAAGTTGACAGCAGCTTTGCAGATGTGTTGCTAAGCTTTCTCACATTGCCACTCGGAACGATCGTGAGAATCTTGAAGAAGCACTACGGAGACGATGCACCCGCCTTTGGAAGCTTGAGCACTCTCTACAACGGTTTAGCAAATCTTGATAGTGACCATTTTTGGACAGAAGGTGCTAAGTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793378.1
MSHAGKDIKFSLKVMVNKKKGKVLFAEVDSSFADVLLSFLTLPLGTIVRILKKHYGDDAPAFGSLSTLYNGLANLDSDHFWTEGAKSILLHPRSSSDAECKKLGLDISDSPPFEYFVCSKECYKLRLRSISMFYDITGKCNSCKGNLIKEVVDNNDAQIVACEDGVFTKTTVSFLITDDLHIMPNAGLSQIVSVLGITDMDEAETILITFGFPNVMDLLKASLTSPTPLSDLIFKKTTKMSSTKRIYEDGTSSISNSKTM...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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