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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G005395`

染色体: Chr02 坐标: 74547680-74549230 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G005395`
名称	SmilChr02G005395
描述	uncharacterized SmilChr02G005395
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	74547680 - 74549230 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010002`
GeneID	`131010002`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010002`
原始查询	`LOC131010002`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	AT3G09110; symbol=AT3G09110; hit=AT3G09110; species=arabidopsis; confidence=low
产物	AT3G09110; symbol=AT3G09110; hit=AT3G09110; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G09110` (AT3G09110) - identity=32.4; qcov=0.724; evalue=7.06e-52; confidence=low
Rice	`Os04g0594500` - identity=30.5; qcov=0.785; evalue=1.05e-41; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF05056 (DUF674)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010002

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057793379.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057793379.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793379.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057793379.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057793379.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:74547694`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C67
`Chr2:74547694`	`G`	`GA`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C67
`Chr2:74547737`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B125,B95,C82
`Chr2:74547895`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B83,C15,C59,C78,C8
`Chr2:74547922`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B136,C15,D9
`Chr2:74547984`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	C11,C69,C9
`Chr2:74547984`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	3	C11,C69,C9
`Chr2:74548002`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	13	A18,A3,B1,B113,B57,B73,B85,C11,C14,C24,C69,C75,C78
`Chr2:74548007`	`TGG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	13	A18,A3,B1,B113,B57,B73,B85,C11,C14,C24,C69,C75,C78
`Chr2:74548010`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	13	A18,A3,B1,B113,B57,B73,B85,C11,C14,C24,C69,C75,C78
`Chr2:74548104`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C29
`Chr2:74548131`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B35,B73,C75

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793379.1

460 aa

230

460

DUF674

PF05056 DUF674 8-427 aa PF05056 DUF674 379-452 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793379.1`	Pfam	`PF05056`	DUF674	Family	8	427	6.6e-101	339.1	Protein of unknown function (DUF674)
`XP_057793379.1`	Pfam	`PF05056`	DUF674	Family	379	452	6.6e-101	339.1	Protein of unknown function (DUF674)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937396.1
ATGTCTCGTGCTGGTAAGGATATTAAGTTTTCATTGAAAGTTATGGTGAATAAAAAGAAAGGGAAGGTTCTATTTGCAGAAGTTGACAGCAGCTTTGCAGATGTGTTGCTAAGCTTTCTCACATTGCCACTCGGAACGATCGTGAGAATCTTGAAGAAGCACTACGGAGACGATGCACCCGCCTTTGGAAGCTTGAGCACTCTCTACAACGGTTTAGCAAATCTTGATAGTGACCATTTTTGGACAGCAGGTGCTAAGTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131010002
ATGTCTCGTGCTGGTAAGGATATTAAGTTTTCATTGAAAGTTATGGTGAATAAAAAGAAAGGGAAGGTTCTATTTGCAGAAGTTGACAGCAGCTTTGCAGATGTGTTGCTAAGCTTTCTCACATTGCCACTCGGAACGATCGTGAGAATCTTGAAGAAGCACTACGGAGACGATGCACCCGCCTTTGGAAGCTTGAGCACTCTCTACAACGGTTTAGCAAATCTTGATAGTGACCATTTTTGGACAGCAGGTGCTAAGTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793379.1
MSRAGKDIKFSLKVMVNKKKGKVLFAEVDSSFADVLLSFLTLPLGTIVRILKKHYGDDAPAFGSLSTLYNGLANLDSDHFWTAGAKSILLHPRSSSDAQCKRLALDISDSPSFQYFICPKGCYKVKLRGVSMYYNFAGKCKFCQSYLIKVVDNNDAQIVACEDGVFTKTTVSFLVTDDLHIMRNAGLLQIVSVLGVTDMEEAEKIHITFGFSNVMDLLKASLTSPTPLSDVIFKKTTEMSSAKRIYVVDINSSISNSKTM...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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