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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G005396`

染色体: Chr02 坐标: 74549662-74551166 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G005396`
名称	SmilChr02G005396
描述	uncharacterized SmilChr02G005396
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	74549662 - 74551166 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010003`
GeneID	`131010003`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010003`
原始查询	`LOC131010003`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	AT3G09110; symbol=AT3G09110; hit=AT3G09110; species=arabidopsis; confidence=low
产物	AT3G09110; symbol=AT3G09110; hit=AT3G09110; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G09110` (AT3G09110) - identity=34.9; qcov=0.741; evalue=6e-53; confidence=low
Rice	`Os04g0594500` - identity=28.1; qcov=0.826; evalue=1.75e-33; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF05056 (DUF674)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010003

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057793381.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057793381.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793381.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057793381.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057793381.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:74549964`	`AGG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	8	A14,B112,B29,B81,B90,B92,C63,D11
`Chr2:74550023`	`G`	`GC`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B131
`Chr2:74550023`	`G`	`GC`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B131
`Chr2:74550096`	`T`	`TGG`	2bp_insertion	frameshift_variant	68	A11,A14,A15,A2,A25,A6,A8,B1,B101,B108,B11,B113,B114,B117,B118,B12,B124,B125,B126,B132,B18,B25,B28,B3,B32,B35,B36,B37,B42,B5,B52,B60,B62,B63,B65,B66,B67,B73,B79,B82,B89,B9,B91,C12,C13,C21,C22,C23,C26,C28,C3,C34,C35,C4,C41,C43,C44,C46,C48,C57,C6,C75,C78,C84,C86,D10,D2,D5
`Chr2:74550098`	`TTA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	68	A11,A14,A15,A2,A25,A6,A8,B1,B101,B108,B11,B113,B114,B117,B118,B12,B124,B125,B126,B132,B18,B25,B28,B3,B32,B35,B36,B37,B42,B5,B52,B60,B62,B63,B65,B66,B67,B73,B79,B82,B89,B9,B91,C12,C13,C21,C22,C23,C26,C28,C3,C34,C35,C4,C41,C43,C44,C46,C48,C57,C6,C75,C78,C84,C86,D10,D2,D5
`Chr2:74550103`	`T`	`TGG`	2bp_insertion	frameshift_variant	18	A5,B111,B133,B138,B16,B2,B24,B30,B46,B55,B93,C2,C63,C67,C68,C70,C74,C81
`Chr2:74550146`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B32
`Chr2:74550252`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B100,B131,B37,C8,D4
`Chr2:74550397`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C2
`Chr2:74550402`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B123,C27
`Chr2:74550472`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D8
`Chr2:74550510`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B123,B140,C85

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793381.1

448 aa

224

448

DUF674

PF05056 DUF674 7-429 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793381.1`	Pfam	`PF05056`	DUF674	Family	7	429	5.6e-88	296.5	Protein of unknown function (DUF674)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937398.1
ATGTCTGACGATAGGGAGGAGGTTAAGTTCTCGTTGAATGTGATGATTAATAAAGAGAAAAGTAAGGTACTATTTGCAGAAGCAGATAACCATTTTGCTGACACTTTGTTAAGCTTCTTGACTTTCCCCTTGGGAAGAATTTTCAAAATCCTCGAGAAGCACTATGGTGATGAAGCTCCCACCATTGGAAGCTTAAGCAGTTTGTACCGTAGCTTAGCAAATCTCGATAGCTCCCATTTTGTGACGGATGGTGCTAAGCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131010003
ATGTCTGACGATAGGGAGGAGGTTAAGTTCTCGTTGAATGTGATGATTAATAAAGAGAAAAGTAAGGTACTATTTGCAGAAGCAGATAACCATTTTGCTGACACTTTGTTAAGCTTCTTGACTTTCCCCTTGGGAAGAATTTTCAAAATCCTCGAGAAGCACTATGGTGATGAAGCTCCCACCATTGGAAGCTTAAGCAGTTTGTACCGTAGCTTAGCAAATCTCGATAGCTCCCATTTTGTGACGGATGGTGCTAAGCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793381.1
MSDDREEVKFSLNVMINKEKSKVLFAEADNHFADTLLSFLTFPLGRIFKILEKHYGDEAPTIGSLSSLYRSLANLDSSHFVTDGAKQILLNPISSFDDEIEGLKLDISDSPPVKYFYCTKSNHNEFRSVSIYYDELLLLSCCKKCFNFMKKKIVPKSSKAASSDGVFAIHKDSFIISDDLQIFPNEMGISGIITIVGIADMDKAELIKVDLGFSEIMNLLKASLTSPTPLSDLILNKTIQMNSSTVESQLNIEEENANSR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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