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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G005415`

染色体: Chr02 坐标: 74623880-74624549 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G005415`
名称	SmilChr02G005415
描述	uncharacterized SmilChr02G005415
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	74623880 - 74624549 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010013`
GeneID	`131010013`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010013`
原始查询	`LOC131010013`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	AT5G01120; symbol=AT5G01120; hit=AT5G01120; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	AT5G01120; symbol=AT5G01120; hit=AT5G01120; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT5G01120` (AT5G01120) - identity=37.4; qcov=0.952; evalue=3.76e-29; confidence=medium
Rice	`Os04g0594500` - identity=32.5; qcov=0.918; evalue=1.27e-24; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF05056 (DUF674)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010013

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057793390.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057793390.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057793390.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793390.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057793390.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:74623889`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B61,B70,C42,C72
`Chr2:74623898`	`G`	`GGT`	2bp_insertion	frameshift_variant	3	B124,B71,C45
`Chr2:74623898`	`G`	`GGT`	2bp_insertion	CDS_variant	3	B124,B71,C45
`Chr2:74623900`	`TGC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	3	B124,B71,C45
`Chr2:74623900`	`TGC`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	3	B124,B71,C45
`Chr2:74623987`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	4	B124,B7,B71,C45
`Chr2:74623987`	`GT`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	4	B124,B7,B71,C45
`Chr2:74624051`	`GAC`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C24
`Chr2:74624051`	`GAC`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C24
`Chr2:74624155`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	6	A1,B22,B34,C30,C31,C69
`Chr2:74624205`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B115,B131,B43,C55
`Chr2:74624252`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	31	A15,A16,A23,A3,A4,B100,B102,B113,B115,B120,B122,B135,B18,B23,B26,B30,B33,B41,B54,B71,B75,B91,C10,C17,C24,C34,C54,C59,C74,C80,C85

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793390.1

208 aa

104

208

DUF674

PF05056 DUF674 8-194 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793390.1`	Pfam	`PF05056`	DUF674	Family	8	194	6.8e-50	170.9	Protein of unknown function (DUF674)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937407.1
ATGTCTGATGATAAAAAGGTTGCTACATTATCGTTGAAAGTGATGATCAATAAAGAGAGAACTAAGGTATTCTTCGCAGAAGCTGACAGCCATTTTGCAGACATTTTGTTTAGCTTCTTGAGTTTGCCGTTGGGAAGAATTGTGAAAGTCCTTGAGAAGCACTATGGAGACGACGAGGCGCCTACCATTGGAAGCTTAAGCAGTTTGTACCGTAGCGTAGTAGATCTCGACAGTGCCCATTTCTGGACAGATGGGGCTAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131010013
ATGTCTGATGATAAAAAGGTTGCTACATTATCGTTGAAAGTGATGATCAATAAAGAGAGAACTAAGGTATTCTTCGCAGAAGCTGACAGCCATTTTGCAGACATTTTGTTTAGCTTCTTGAGTTTGCCGTTGGGAAGAATTGTGAAAGTCCTTGAGAAGCACTATGGAGACGACGAGGCGCCTACCATTGGAAGCTTAAGCAGTTTGTACCGTAGCGTAGTAGATCTCGACAGTGCCCATTTCTGGACAGATGGGGCTAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793390.1
MSDDKKVATLSLKVMINKERTKVFFAEADSHFADILFSFLSLPLGRIVKVLEKHYGDDEAPTIGSLSSLYRSVVDLDSAHFWTDGAKQTLLDPTSSSEAEYQRLKLDITDFQPAKYFCCNRYDPIYHSRCTRFRSVSIYYDHIKRCKVCSIDGAMKIEVVKKGSEAAASRDGVFTMNTSSFIISDDLNIFPNETGLLGKSKWIWALVR

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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