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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G005426`

染色体: Chr02 坐标: 74721224-74721853 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G005426`
名称	SmilChr02G005426
描述	uncharacterized SmilChr02G005426
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	74721224 - 74721853 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010017`
GeneID	`131010017`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010017`
原始查询	`LOC131010017`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	AT3G09110; symbol=AT3G09110; hit=AT3G09110; species=arabidopsis; confidence=low
产物	AT3G09110; symbol=AT3G09110; hit=AT3G09110; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G09110` (AT3G09110) - identity=31.9; qcov=0.871; evalue=1.76e-22; confidence=low
Rice	`Os04g0594700` - identity=31.5; qcov=0.957; evalue=2.1e-22; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF05056 (DUF674)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010017

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057793395.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057793395.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793395.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057793395.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057793395.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:74721260`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B128,B133,B35,C67
`Chr2:74721275`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B128,B133,B35,C67,C70
`Chr2:74721348`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A7,B104
`Chr2:74721481`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B45
`Chr2:74721517`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	80	A1,A11,A2,A21,A23,A4,A6,B10,B104,B105,B108,B109,B11,B111,B112,B113,B115,B12,B121,B123,B129,B130,B133,B134,B137,B138,B15,B17,B18,B19,B25,B28,B30,B32,B35,B45,B46,B49,B50,B51,B54,B55,B60,B63,B66,B67,B69,B76,B8,B80,B83,B95,B97,C1,C13,C16,C19,C22,C23,C24,C33,C35,C37,C38,C42,C43,C48,C50,C61,C64,C71,C74,C77,C78,C8,C82,C84,C86,C87,D11
`Chr2:74721519`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	74	A11,A2,A21,A23,A4,A6,B10,B104,B105,B108,B109,B11,B112,B113,B115,B12,B121,B129,B133,B134,B137,B138,B15,B17,B18,B19,B25,B28,B30,B35,B45,B46,B49,B50,B51,B54,B55,B63,B66,B67,B69,B76,B8,B80,B83,B95,B97,C1,C13,C16,C19,C22,C23,C24,C33,C35,C37,C38,C42,C43,C48,C50,C61,C64,C71,C74,C77,C78,C8,C82,C84,C86,C87,D11
`Chr2:74721522`	`G`	`GTC`	2bp_insertion	stop_gained,frameshift_variant	74	A11,A2,A21,A23,A4,A6,B10,B104,B105,B108,B109,B11,B112,B113,B115,B12,B121,B129,B133,B134,B137,B138,B15,B17,B18,B19,B25,B28,B30,B35,B45,B46,B49,B50,B51,B54,B55,B63,B66,B67,B69,B76,B8,B80,B83,B95,B97,C1,C13,C16,C19,C22,C23,C24,C33,C35,C37,C38,C42,C43,C48,C50,C61,C64,C71,C74,C77,C78,C8,C82,C84,C86,C87,D11
`Chr2:74721525`	`ATG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	74	A11,A2,A21,A23,A4,A6,B10,B104,B105,B108,B109,B11,B112,B113,B115,B12,B121,B129,B133,B134,B137,B138,B15,B17,B18,B19,B25,B28,B30,B35,B45,B46,B49,B50,B51,B54,B55,B63,B66,B67,B69,B76,B8,B80,B83,B95,B97,C1,C13,C16,C19,C22,C23,C24,C33,C35,C37,C38,C42,C43,C48,C50,C61,C64,C71,C74,C77,C78,C8,C82,C84,C86,C87,D11
`Chr2:74721530`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B25,C74,C87
`Chr2:74721611`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B106,B129,C24,C50
`Chr2:74721614`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B49,B60,B8,C19
`Chr2:74721686`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A3

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793395.1

209 aa

104

209

DUF674

PF05056 DUF674 9-188 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793395.1`	Pfam	`PF05056`	DUF674	Family	9	188	2.2e-40	139.6	Protein of unknown function (DUF674)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937412.1
ATGTCCAATTACGGCAAGGATGCGGCGGCGGTATCGTTGGCGGTTATGGTGAATAAAGAGAGAAACAAGGTGCTCTTCGCCGTCGCCGACAACCACTTCGCAGACATTTTGATCAGCTTCTTGACCTTGCCGTTGGGAAGAATCCTCAAATTCCTCGAAGCAAACCACAACGCTGCTAAGGGGCCACGCACCATTGGAAGCTTAAGCAGTTTTTACCGCAGCATAGCGAATCTCGACGCCTCCGAATTTGTGACGGACGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131010017
ATGTCCAATTACGGCAAGGATGCGGCGGCGGTATCGTTGGCGGTTATGGTGAATAAAGAGAGAAACAAGGTGCTCTTCGCCGTCGCCGACAACCACTTCGCAGACATTTTGATCAGCTTCTTGACCTTGCCGTTGGGAAGAATCCTCAAATTCCTCGAAGCAAACCACAACGCTGCTAAGGGGCCACGCACCATTGGAAGCTTAAGCAGTTTTTACCGCAGCATAGCGAATCTCGACGCCTCCGAATTTGTGACGGACGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793395.1
MSNYGKDAAAVSLAVMVNKERNKVLFAVADNHFADILISFLTLPLGRILKFLEANHNAAKGPRTIGSLSSFYRSIANLDASEFVTDGAKQALLNPRSSFEADCERLKLDISRTPPAEYFRCANNDHPKYRSLSLYYDTLGGLVLCPTYRRCGIMTKVVAQKSSAFRVFTKQEASFIIYDDLQIFPNDTGISGIMSFLGIGDCKAETIEV

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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