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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G005447`

染色体: Chr02 坐标: 74829739-74831528 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G005447`
名称	SmilChr02G005447
描述	paired amphipathic helix protein Sin3-like 3
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	74829739 - 74831528 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010018`
GeneID	`131010018`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010018`
原始查询	`LOC131010018`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	paired amphipathic helix protein Sin3-like 3
产物	paired amphipathic helix protein Sin3-like 3
Arabidopsis	`AT1G24190` (SNL3) SIN3-like 3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839032] identity=31.4; qcov=0.47; evalue=3.75e-16; confidence=low
Rice	`Os05g0100500` - identity=28.5; qcov=0.539; evalue=1.55e-13; confidence=low
GO	GO:0000118 (histone deacetylase complex); GO:0000122 (negative regulation of transcription by RNA polymerase II); GO:0000785 (chromatin); GO:0003714 (transcription corepressor activity); GO:0016575 (GO:0016575)
KEGG	-
Pfam	PF02671 (PAH)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010018

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057793396.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057793396.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793396.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057793396.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057793396.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:74829844`	`C`	`CG`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C72
`Chr2:74829844`	`C`	`CG`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C72
`Chr2:74829848`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	C72,C85
`Chr2:74829848`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	2	C72,C85
`Chr2:74829856`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B27,B72,D2
`Chr2:74829868`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B78
`Chr2:74829869`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C46
`Chr2:74829892`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C77
`Chr2:74829892`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C77
`Chr2:74829910`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B32,C59
`Chr2:74829954`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B122,B55
`Chr2:74829978`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B5,C61

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793396.1

332 aa

166

332

PAH

PF02671 PAH 27-68 aa PF02671 PAH 117-160 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793396.1`	Pfam	`PF02671`	PAH	Repeat	27	68	4.5e-21	75.0	Paired amphipathic helix repeat
`XP_057793396.1`	Pfam	`PF02671`	PAH	Repeat	117	160	4.5e-21	75.0	Paired amphipathic helix repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937413.1
AGCACGTATAGACATACATCAAATTACACCATCGATCAAAGCCATGGCTCCTCTCCTCTCCACCGCCCTACAATACATACGCGAAGTTAAGTCCACCACCGCCGCCGCGGACGACGGCGGCCAAATCTACGGCGAATTTCTCCAAACCCTAAAGCAATACCGCAAAAGAAACTTGGATTCTTCCATCGTGACTTCCACCGTTCAAACACTCTTCCGCAGCCACCCCAACCTGCTCGATGGTTTCAACCTTTACGCTCCCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131010018
ATGGCTCCTCTCCTCTCCACCGCCCTACAATACATACGCGAAGTTAAGTCCACCACCGCCGCCGCGGACGACGGCGGCCAAATCTACGGCGAATTTCTCCAAACCCTAAAGCAATACCGCAAAAGAAACTTGGATTCTTCCATCGTGACTTCCACCGTTCAAACACTCTTCCGCAGCCACCCCAACCTGCTCGATGGTTTCAACCTTTACGCTCCCGCCGCCGCGGCTGCCGCGGCAACCGCGGCGGCGGGGGAGAATTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793396.1
MAPLLSTALQYIREVKSTTAAADDGGQIYGEFLQTLKQYRKRNLDSSIVTSTVQTLFRSHPNLLDGFNLYAPAAAAAAATAAAGENSGREFLNRVRLRSCADFLNRAGARFDGGGAYRKFLECMHAYSRGEIAAEAVADEVAGIFGRNNGDLVREFARFLPEQKLQTQPASAGEEEASRKRKREIAGTDKPGTKKRRDPISFAVPAWRGREQRGSDEEEAAKRDYEMEDSLFEIDVRIGRLTSAGISAANLHRGISDGGV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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