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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003545`

染色体: Chr01 坐标: 54039767-54043050 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003545`
名称	SmilChr01G003545
描述	uncharacterized SmilChr01G003545
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	54039767 - 54043050 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010034`
GeneID	`131010034`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010034`
原始查询	`LOC131010034`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; KEGG smil; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0115500; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os06g0115500; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G49010` (BBC1) breast basic conserved 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824062] identity=74.4; qcov=0.322; evalue=1.22e-09; confidence=low
Rice	`Os06g0115500` - identity=71.8; qcov=0.322; evalue=2.76e-10; confidence=low
GO	-
KEGG	smil03010 (Ribosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010034

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057793415.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057793415.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793415.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057793415.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057793415.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:54042082`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C58
`Chr1:54042086`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A16,A6,B28,C33
`Chr1:54042094`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C74,D2
`Chr1:54042136`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	A21,B126
`Chr1:54042136`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	2	A21,B126
`Chr1:54042137`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A15,C12
`Chr1:54042166`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B123,B72,C10,C63
`Chr1:54042203`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C32
`Chr1:54042213`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B20,B24,B80
`Chr1:54042216`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B113,B21,B43,B61,C43
`Chr1:54042222`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B8
`Chr1:54042223`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A21,B126,C34

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预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937432.1
ATGAATGACGCTGTCTCCCAAAATTCATCGTCTTCCTCTGAGCTCGAATCCCCGTCCACTGCCAGTGCTCCGACCGGTCTCGATTCTCTCAAAGCACCACGGGAACTCGCTCTTGCCCTACCTCTCGCCGTTGTCCGCGACTCCGGCTCCACCTATGCTCTGCCTGCTTACAGGCAGCAGTACAGAGCTAGGAGGAGCTCCCCGTCGTCCCCCTGCTCATCACCAAATGTTGAGCTTGTGAAGATCACACAAGACATGAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131010034
ATGAATGACGCTGTCTCCCAAAATTCATCGTCTTCCTCTGAGCTCGAATCCCCGTCCACTGCCAGTGCTCCGACCGGTCTCGATTCTCTCAAAGCACCACGGGAACTCGCTCTTGCCCTACCTCTCGCCGTTGTCCGCGACTCCGGCTCCACCTATGCTCTGCCTGCTTACAGGCAGCAGTACAGAGCTAGGAGGAGCTCCCCGTCGTCCCCCTGCTCATCACCAAATGTTGAGCTTGTGAAGATCACACAAGACATGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793415.1
MNDAVSQNSSSSSELESPSTASAPTGLDSLKAPRELALALPLAVVRDSGSTYALPAYRQQYRARRSSPSSPCSSPNVELVKITQDMKSFKAYDKLRLERTNARHVGVRAKRAAEAEKEDKK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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