当前解析结果
SmilChr02G003089| 统一新 Gene ID | SmilChr02G003089 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G003089 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr02G003089 |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 51769788 - 51771394 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131010101 |
|---|---|
| GeneID | 131010101 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131010101 |
| 原始查询 | LOC131010101 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131010101 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057793483.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.20000 | XP_057793483.1 |
| 3 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.20000 | XP_057793483.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057793483.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057793483.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr2:51770002 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B74 |
Chr2:51770033 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B109,B11,C44,C55 |
Chr2:51770037 |
G |
GT |
1bp_insertion | frameshift_variant | 4 | B68,B72,B76,C46 |
Chr2:51770037 |
G |
GT |
1bp_insertion | CDS_variant | 4 | B68,B72,B76,C46 |
Chr2:51770060 |
TG |
T |
1bp_deletion | frameshift_variant | 1 | B51 |
Chr2:51770060 |
TG |
T |
1bp_deletion | CDS_variant | 1 | B51 |
Chr2:51770075 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C28,C64 |
Chr2:51770197 |
ATC |
A |
2bp_deletion | frameshift_variant | 205 | A1,A14,A15,A16,A18,A2,A20,A21,A22,A23,A24,A25,A3,A4,A5,A6,A7,A8,A9,B1,B10,B100,B101,B102,B103,B104,B105,B106,B107,B108,B109,B110,B111,B112,B113,B114,B115,B117,B118,B119,B120,B121,B122,B124,B125,B126,B127,B128,B129,B13,B131,B133,B134,B136,B14,B140,B15,B16,B17,B18,B2,B20,B21,B22,B23,B24,B25,B26,B27,B28,B29,B3,B30,B32,B33,B34,B35,B36,B37,B38,B39,B4,B40,B43,B44,B49,B50,B51,B52,B53,B55,B56,B57,B58,B59,B6,B60,B61,B62,B63,B66,B67,B69,B70,B72,B73,B74,B75,B76,B77,B78,B79,B8,B80,B82,B84,B86,B87,B88,B9,B90,B91,B92,B93,B94,B95,B96,B97,B98,B99,C1,C10,C11,C13,C14,C15,C16,C17,C18,C19,C2,C20,C21,C25,C26,C27,C28,C29,C3,C30,C31,C33,C34,C35,C36,C37,C38,C39,C4,C41,C42,C43,C44,C45,C46,C47,C48,C49,C5,C51,C52,C53,C57,C58,C59,C61,C63,C64,C67,C7,C70,C72,C73,C75,C76,C77,C78,C79,C8,C80,C82,C83,C84,C85,C86,C87,C9,D1,D10,D2,D3,D5,D7,D8,D9 |
Chr2:51770463 |
TGG |
T |
2bp_deletion | frameshift_variant | 28 | A14,B10,B105,B126,B27,B38,B52,B55,B60,B61,B70,B73,B79,B82,B88,B90,B94,B96,B99,C21,C26,C28,C35,C57,C75,C78,C79,C9 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。