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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003101`

染色体: Chr02 坐标: 51932205-51939510 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003101`
名称	SmilChr02G003101
描述	F-box protein At3g07870-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	51932205 - 51939510 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010110`
GeneID	`131010110`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010110`
原始查询	`LOC131010110`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	F-box protein At3g07870-like
产物	F-box protein At3g07870-like
Arabidopsis	`AT4G12560` (CPR1) F-box and associated interaction domains-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826869] identity=25.2; qcov=0.973; evalue=6.65e-20; confidence=low
Rice	`Os04g0194000` (OsFbox184) - identity=26.7; qcov=0.9; evalue=3.79e-17; confidence=low
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00646 (F-box); PF07734 (FBA_1); PF08268 (FBA_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010110

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057793494.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057793494.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057793494.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793494.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057793494.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:51932666`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B130,B54
`Chr2:51932760`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B30,B32,B36,B51
`Chr2:51932761`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B95
`Chr2:51932779`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B95
`Chr2:51932810`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7
`Chr2:51932817`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B108,B26,B71,C30,C50
`Chr2:51932827`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B46
`Chr2:51932883`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A14,B22,B28,B40,B51
`Chr2:51933352`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C47
`Chr2:51933360`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B35,B4
`Chr2:51933454`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A20,B111,B122,C56
`Chr2:51933507`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793494.1

400 aa

200

400

F-box

FBA_3

FBA_1

PF00646 F-box 18-57 aa PF08268 FBA_3 75-322 aa PF07734 FBA_1 113-325 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793494.1`	Pfam	`PF00646`	F-box	Domain	18	57	7.4e-05	23.2	F-box domain
`XP_057793494.1`	Pfam	`PF08268`	FBA_3	Repeat	75	322	2.4e-23	83.3	F-box associated beta propeller domain
`XP_057793494.1`	Pfam	`PF07734`	FBA_1	Repeat	113	325	8.4e-20	71.7	F-box associated beta propeller domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937511.1
TTGCTCGATATTGAATTAGTTCAAATTATTCGATATTATCATATTAGTATTGTCATATGGACGACCAAACATAATCTACCAAATCGACTACATATCAAACTGAGCCCATCCAACTTATCATGTGATTAAATCTAATCTTATCTATCAAATCGACTACATTTAAATGATAGGTGGTTAATGTTCAAAGTCTGAAGTTCTGGGTTCGAGTAAACGGTTGTGCGATTTTTAAAATATTTTTATTTACTTGTGTAATTTATCAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131010110
ATGCATAGACAGAGCAATCACACCACCACCACAAAAATGAAACGAGATTTCTTCACAAATTTACCTTCAGAAATCACCATAAACATCCTCTCAAGACTCCCACTTGGAGGCATCGCAATGAGCAAGTGTGTTTGTAAGCCATGGCTTCATCTGCTCGCTACCGACGACTTCATCAAATCCCATCTTGCTAAATCCACCCCCGCCCTAGCTGTCTTGACTTCGTCTTCCTGCACAGTTTTCGAATTCGAAGACCACCAAAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793494.1
MHRQSNHTTTTKMKRDFFTNLPSEITINILSRLPLGGIAMSKCVCKPWLHLLATDDFIKSHLAKSTPALAVLTSSSCTVFEFEDHQNLDRHDLHYNPLIKFDLPHAAGIQDSANGLLFLSMSEAHYVCNPITRQYAELHYPREIIRSFPKVVNYPEILSGSLHSYPQSVTYGFGASRITGQHKVVQIYHDSVIVDGGIRTIPESECHVHTLGTGTWRRVKPGALLEYSPRSSCVFLNGNLHWVASDSDDRLWISCFDLET...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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