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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003162`

染色体: Chr02 坐标: 52663197-52666161 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003162`
名称	SmilChr02G003162
描述	uncharacterized membrane protein At4g09580-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	52663197 - 52666161 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010154`
GeneID	`131010154`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010154`
原始查询	`LOC131010154`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	SNARE associated Golgi protein family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826542]; symbol=AT4G09580; hit=AT4G09580; species=arabidopsis; confidence=high
产物	SNARE associated Golgi protein family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826542]; symbol=AT4G09580; hit=AT4G09580; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT4G09580` (AT4G09580) SNARE associated Golgi protein family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826542] identity=69.8; qcov=0.931; evalue=2.3e-143; confidence=high
Rice	`Os03g0703900` (OSJNBa0004L11.6) - identity=64.9; qcov=0.912; evalue=3.95e-119; confidence=high
GO	GO:0005783 (endoplasmic reticulum)
KEGG	-
Pfam	PF09335 (VTT_dom)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010154

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057793552.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	1.00000	`XP_057793552.1`
3	Golgi apparatus	高尔基体	0.20000	`XP_057793552.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057793552.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793552.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:52663785`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B80
`Chr2:52664759`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr2:52664804`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B55,B8,C8
`Chr2:52664817`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A23,B18,C70,C82
`Chr2:52665405`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr2:52665420`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B1,D4
`Chr2:52665468`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B10,B8,C2,C74
`Chr2:52665720`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A5,B122,C30

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793552.1

306 aa

153

306

VTT_dom

PF09335 VTT_dom 147-266 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793552.1`	Pfam	`PF09335`	VTT_dom	Domain	147	266	1.2e-14	55.6	VTT domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937569.1
ATAATAGAATCCACCAAGAAGAAAGATAGGATCCAAAACGCATATGCTACATGTGTTAGATTATCACACATAGCTGGACTCCGGAGATATGATCCAACAAAACCAAATCCCTAAATCTGCGTTTGTGTTCTCAAATTCAAACAATTGCTGAACAACCATTTGACTCCTATTCCACTTCTCTCTCAATTTTGATTCTAGGGTTTCTTTTATGATCAATTATCAACCCTTCATTTTTATTTCCTCCAATTCTATTGATATAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131010154
ATGAAGGCTACTAAAATCCTGCGCAGTACGTCGGCCCCCAACACTTTTTTCGAGTCATTTTCGACGTCGTCCGCGCCATCAATTTCCATGGCGGCGCCGCGGAGCGTGTACGTGGAGAGCGGCGGCGGCGGGAGGTCGCTGGATGAGGACAGGGAGAAGAATGCGGAGTCTCCGACGGACAAGAAATACAGGGCGGATAAATCGCCGCCCTCTAGGTGGGAATTCGTGGCGGCGTTGGGGGTATTTTTGGCATTTTCGTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793552.1
MKATKILRSTSAPNTFFESFSTSSAPSISMAAPRSVYVESGGGGRSLDEDREKNAESPTDKKYRADKSPPSRWEFVAALGVFLAFSSALLFIYLTMPTAEYEILKLPRTLADLRLLKDHLASYARHYPAKFILGYCSTYIFMQTFMIPGTIFMSLLAGALFGVGRGLFLVVFNATAGASSCYFLSKLIGRPIVVWLWPEKLRYFQAEIARHRDKLLNYMLFLRVTPTLPNLFINLASPIVDIPFYIFFLATIIGLIPASY...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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