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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003166`

染色体: Chr02 坐标: 52684719-52691640 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003166`
名称	SmilChr02G003166
描述	uncharacterized SmilChr02G003166
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	52684719 - 52691640 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010157`
GeneID	`131010157`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010157`
原始查询	`LOC131010157`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	erythroid differentiation factor-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840468]; symbol=AT1G35660; hit=AT1G35660; species=arabidopsis; confidence=high
产物	erythroid differentiation factor-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840468]; symbol=AT1G35660; hit=AT1G35660; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G35660` (AT1G35660) erythroid differentiation factor-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840468] identity=54.1; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0873800` - identity=50.2; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding); GO:0045893 (positive regulation of DNA-templated transcription)
KEGG	-
Pfam	PF23788 (EDRF1_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010157

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057793555.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057793555.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057793555.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793555.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057793555.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:52685051`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B10,B72,B94,C74
`Chr2:52685172`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B30,B62,C35,C37
`Chr2:52685863`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C36
`Chr2:52685895`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr2:52686335`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C61
`Chr2:52686528`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B64
`Chr2:52687099`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B101,B139,B4,D1
`Chr2:52687354`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B77
`Chr2:52687354`	`TA`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B77
`Chr2:52687683`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B140,B53,C17,C63
`Chr2:52688659`	`GTT`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B80
`Chr2:52688659`	`GTT`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B80

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793555.1

1447 aa

724

1447

EDRF1_N

PF23788 EDRF1_N 121-572 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793555.1`	Pfam	`PF23788`	EDRF1_N	Domain	121	572	5.4e-51	174.7	EDRF1 N-terminal

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937572.1
CCGAAATAACCAGACGTCGTCTACATAAAATTTTTCTGAGATTTGCATAAGAGGGAAAAACCACTTCAGAAAAACCTCAACTTCCATTGAGCAGCGAACTTCGACCACCATCAAAATTGAACGTCTCTTTGTAAACCCTATATGTGTAATTTCTGCTCTGCTGCTTAATACTGTATTTTCAGTGATAAATGGAGAAGCAAGGATCAGGCTCGCTGGAATTACAATGCGTCGGAAAACTGGAAATCGCGCGGCCGAAGCCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131010157
ATGGAGAAGCAAGGATCAGGCTCGCTGGAATTACAATGCGTCGGAAAACTGGAAATCGCGCGGCCGAAGCCTGTCGGTTTTCTCTGCGGCTCAATTCCCGTGACCACTGATGAGGCTTTTCACGATTTTAGCTCCGCCGCGCTAGTTCCGTCTCCGAATACGGTAAGCGCTCCAAGGTATCGGATGATTCCAACAGAAACTGATCTGAATGCGCTCCCTTTACTATCAAGTATTCCTGAAAGAGTGCTACCAGTTGCAGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793555.1
MEKQGSGSLELQCVGKLEIARPKPVGFLCGSIPVTTDEAFHDFSSAALVPSPNTVSAPRYRMIPTETDLNALPLLSSIPERVLPVAATQARTNGDSSWQGAPITSSLARKGEALAVTGLTEYGDEIDVIAPADILKQLFKIPYSKARVSIAVHRVGQTLVLNSGPDTEEGEKLIRRQNHQPKCVDQSLFLNFAMHSVRMEACDCPPSHNTSMDEQFKSSIYTDECISSEGSLGSSNHPTQGHAPGRQREGIVQEDKYAHQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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