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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003179`

染色体: Chr02 坐标: 52941170-52944762 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003179`
名称	SmilChr02G003179
描述	protein disulfide isomerase-like 5-2
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	52941170 - 52944762 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010164`
GeneID	`131010164`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010164`
原始查询	`LOC131010164`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein disulfide isomerase-like 5-2
产物	protein disulfide isomerase-like 5-2
Arabidopsis	`AT1G35620` (PDIL5-2) PDI-like 5-2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840461] identity=60.9; qcov=0.928; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os04g0432500` (PDIL5) - identity=60; qcov=0.845; evalue=2.21e-176; confidence=high
GO	GO:0003756 (protein disulfide isomerase activity); GO:0005783 (endoplasmic reticulum); GO:0006457 (protein folding); GO:0034976 (response to endoplasmic reticulum stress)
KEGG	smil04141 (Protein processing in endoplasmic reticulum - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00085 (Thioredoxin); PF13848 (Thioredoxin_6)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010164

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057793567.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.60000	`XP_057793567.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057793567.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793567.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057793567.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:52941510`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B114,B134,C29,C6
`Chr2:52941623`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B102
`Chr2:52942039`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C28,C85
`Chr2:52942797`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B74
`Chr2:52942830`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B72
`Chr2:52942860`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A23
`Chr2:52943018`	`CAG`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B132
`Chr2:52943018`	`CAG`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B132
`Chr2:52944417`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B1,B94
`Chr2:52944427`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C60

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793567.1

446 aa

223

446

Thioredoxin

Thioredoxin_6

PF00085 Thioredoxin 45-146 aa PF13848 Thioredoxin_6 188-361 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793567.1`	Pfam	`PF00085`	Thioredoxin	Domain	45	146	2.2e-26	92.6	Thioredoxin
`XP_057793567.1`	Pfam	`PF13848`	Thioredoxin_6	Domain	188	361	1.1e-10	42.4	Thioredoxin-like domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937584.1
CCCCTAACTTATGAAAACTGAAAAGTAAAAAACAAAATATTATATCATACTTTTCTTCGGCAGTAAAAAATTCAGAGACCAAAATCTGTAGTAAATCCCTACAAAAACCAAAACCAAAACTATCACCATTTCCAATCATCAAAATCTTCAATGGCATCTTCTCCTCTAACGATCTACTGCTGTCTCGCAAAATTTTATCTCCAACTACTATCGTTGCTTTCCGTAGTTCTACTTTCTACGGCGATCGGCGCATCGGTAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131010164
ATGGCATCTTCTCCTCTAACGATCTACTGCTGTCTCGCAAAATTTTATCTCCAACTACTATCGTTGCTTTCCGTAGTTCTACTTTCTACGGCGATCGGCGCATCGGTAAATCAGTTCAAGTTGGACGGCAAAGTGTTGGAGCTCGACGACTCCAATTTCGATGCTGCAATTTCGAATTTCGATTACGTTTTCGTCGATTTTTACGCCCCTTGGTGCGGCCACTGCAAGCGTCTCGCGCCTGAGTTAGATAAAGCGGCCCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793567.1
MASSPLTIYCCLAKFYLQLLSLLSVVLLSTAIGASVNQFKLDGKVLELDDSNFDAAISNFDYVFVDFYAPWCGHCKRLAPELDKAAPVLAGLKPPVVVAKVDADKYRKLGSKHDIDGYPTLKVFIHGVPTEYFGPRKADLLVQYLTKFVAPDVAFLNSDSAIRDFIKAAGTNFPIFIGFGLNETSISEIAVKYKKKAWFSVAKDFSEDIMSLYDFDKEPALVAIHPAYNEQSIFYGPFEENFVEDYVKQSMLPLILPLNQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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