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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003180`

染色体: Chr02 坐标: 52957826-52961620 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003180`
名称	SmilChr02G003180
描述	DNA repair protein XRCC2 homolog
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	52957826 - 52961620 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010166`
GeneID	`131010166`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010166`
原始查询	`LOC131010166`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Arabidopsis/Rice homolog
描述	DNA repair protein XRCC2 homolog
产物	DNA repair protein XRCC2 homolog
Arabidopsis	`AT5G64520` (XRCC2) homolog of X-ray repair cross complementing 2 (XRCC2) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836573] identity=48.1; qcov=1.04; evalue=2.42e-99; confidence=high
Rice	`Os01g0870300` (OsAMT3) - identity=47.7; qcov=0.542; evalue=4.68e-47; confidence=medium
GO	GO:0000724 (double-strand break repair via homologous recombination); GO:0003677 (DNA binding); GO:0005524 (ATP binding); GO:0005657 (replication fork); GO:0033063 (Rad51B-Rad51C-Rad51D-XRCC2 complex); GO:0140664 (ATP-dependent DNA damage sensor activity)
KEGG	smil03440 (Homologous recombination - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010166

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057793569.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057793569.1`
3	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057793569.1`
4	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057793569.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793569.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:52958979`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B24
`Chr2:52958991`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A2,B122,B82,C60,C61
`Chr2:52959292`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C76,C87
`Chr2:52959326`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr2:52959602`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B140,B53,C17
`Chr2:52961478`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B35,C28,C81,C85
`Chr2:52961596`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	7	B107,B55,C2,C32,C68,C8,C85

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预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937586.1
CCTCTTCTTCCCGCCCAAATGCAACAGCCAAGAGACATGACGCCAGCATTTTCATGGATCACAGCAGACGAAACAGCCGAGCAAGCACTCGTCAGAATCCTCACAGAGCGCCCCTTTCTCATATTGCCGCCGCCGTTCCACCGCCTCCCCCTCCGCGCCGGCAACGTCGTCGAAATCGTGGGGCCCTCTCCTTCGGCCAAAACCCTAATCCTCATCCAGGCAGCGATAAATTGTATTTTGCCTAAAGAGTGGAAGGGCGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131010166
ATGCAACAGCCAAGAGACATGACGCCAGCATTTTCATGGATCACAGCAGACGAAACAGCCGAGCAAGCACTCGTCAGAATCCTCACAGAGCGCCCCTTTCTCATATTGCCGCCGCCGTTCCACCGCCTCCCCCTCCGCGCCGGCAACGTCGTCGAAATCGTGGGGCCCTCTCCTTCGGCCAAAACCCTAATCCTCATCCAGGCAGCGATAAATTGTATTTTGCCTAAAGAGTGGAAGGGCGTGAGCTATGGGGGGCTGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793569.1
MQQPRDMTPAFSWITADETAEQALVRILTERPFLILPPPFHRLPLRAGNVVEIVGPSPSAKTLILIQAAINCILPKEWKGVSYGGLERAVLFIDLDCRFDVSSISRALQRRIIEANGLRSSLKGSGNEYDKELFVACLRRFLYRRCYNSFEFIATLKTLHHRLHQEKEKGGSAVYILLIDSIGAFYWMDRALPSSSTRNNNRKSLSLQTVVETVVQEIQRLLVVHPILVLATKSAVFGDKQSTTDVIRKRPDEKTSDPRG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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