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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003183`

染色体: Chr02 坐标: 52983766-52986112 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003183`
名称	SmilChr02G003183
描述	uncharacterized SmilChr02G003183
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	52983766 - 52986112 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010174`
GeneID	`131010174`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010174`
原始查询	`LOC131010174`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Vacuolar ATPase assembly integral membrane protein VMA21-like domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837086]; symbol=AT1G05780; hit=AT1G05780; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	Vacuolar ATPase assembly integral membrane protein VMA21-like domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837086]; symbol=AT1G05780; hit=AT1G05780; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT1G05780` (AT1G05780) Vacuolar ATPase assembly integral membrane protein VMA21-like domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837086] identity=58.2; qcov=0.961; evalue=9.75e-33; confidence=medium
Rice	`Os04g0612900` - identity=53.4; qcov=1.01; evalue=1.24e-31; confidence=medium
GO	GO:0005789 (endoplasmic reticulum membrane); GO:0070072 (vacuolar proton-transporting V-type ATPase complex assembly)
KEGG	-
Pfam	PF09446 (VMA21)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010174

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057793579.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	1.00000	`XP_057793579.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057793579.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793579.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057793579.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:52984023`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B72,C74
`Chr2:52984050`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	22	A19,A2,B104,B125,B126,B128,B17,B21,B33,B51,B52,B58,B65,B7,B78,B80,C36,C55,C60,C62,C8,C82
`Chr2:52984144`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B72,C74
`Chr2:52985471`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B107
`Chr2:52985506`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A6,B131,B20,C6,C79

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793579.1

102 aa

102

VMA21

PF09446 VMA21 4-66 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793579.1`	Pfam	`PF09446`	VMA21	Domain	4	66	1.2e-21	77.2	VMA21-like domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937596.1
TTCGGACTCATAGCTCCAATTTAAGATTCAATCAAATTAATACCCAGTTCGTTCGAAATCTGGTGTTAGGTTAATTTTTGGGGGTCATTTGGGGTTGGAGAAGTTCAAGGAAGAGCTCAAACTGAATGGGATCGAATTATAGGTTTGAAGAGCTATGATGGGAGTGGTAAACAAGTTCGTAATCGCGTCCATGTGCATGTTTGCAGCTCCTATCGCGATTCTATATGGATTCAAACACAATTTCTTACCCGGTTCTACTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131010174
ATGATGGGAGTGGTAAACAAGTTCGTAATCGCGTCCATGTGCATGTTTGCAGCTCCTATCGCGATTCTATATGGATTCAAACACAATTTCTTACCCGGTTCTACTGAATTGCCTTCAGAGTCCGTGACTCTATGGAGCGGAATCCTCGCAGTCTTTTCCGTCAACGTGGTCATAGCATTCTACATCTACATGGCCCTGAAAGAGCCCTCGGGCAAGCCAGAGCCAGATCTTAAGTTCGTTGCAGAGGCCAAGGCCAGCAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793579.1
MMGVVNKFVIASMCMFAAPIAILYGFKHNFLPGSTELPSESVTLWSGILAVFSVNVVIAFYIYMALKEPSGKPEPDLKFVAEAKASIKQSQPSRASDRSKHK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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