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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003211`

染色体: Chr02 坐标: 53298547-53300564 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003211`
名称	SmilChr02G003211
描述	transcription factor TCP23-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	53298547 - 53300564 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010183`
GeneID	`131010183`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010183`
原始查询	`LOC131010183`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transcription factor TCP23-like
产物	transcription factor TCP23-like
Arabidopsis	`AT1G58100` (TCP8) TCP family transcription factor [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842177] identity=47.9; qcov=0.857; evalue=5.43e-72; confidence=high
Rice	`Os12g0173300` (OsTCP28) - identity=45.6; qcov=0.687; evalue=7.06e-54; confidence=high
GO	GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0005634 (nucleus); GO:0043565 (sequence-specific DNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF03634 (TCP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010183

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057793592.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793592.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057793592.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057793592.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057793592.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:53299196`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B124,B27,C25
`Chr2:53299199`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C22
`Chr2:53299288`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B86
`Chr2:53299312`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B80
`Chr2:53299314`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B95
`Chr2:53299388`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A22,B127,B23
`Chr2:53299394`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B115,B17,C45
`Chr2:53299571`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B117,B24
`Chr2:53299787`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C29,C40,C6,D10
`Chr2:53300025`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B107,B59
`Chr2:53300025`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B107,B59
`Chr2:53300096`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B107

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793592.1

412 aa

206

412

TCP

PF03634 TCP 117-219 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793592.1`	Pfam	`PF03634`	TCP	Family	117	219	2e-32	113.6	TCP family transcription factor

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937609.1
ACAGACTATTTATGTTTATAAAATAAATATTTTTTCATATATTACTAAATACAAGCGAGCATTTAACTCATAATAATTTAAATAGGCCAAATTGATGTATTTTAGCAAAAATAATCGTATATATAAAAATAAAAAAAGAAGGGATGAAAACTGATAGTTTTGGAGGGAGCCAGCTAAAATGCACTGTGATAAAATATTAATAGAAGAAAGACCCCACGGGTGGGCTTCAGCTTCTGCAAACATTTATTTATCTTTTTGCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131010183
ATGGAATTTATGGAGACACACGCCAAAAATCAAGGAGCCAATAGTAATCCCAACCCGGACCGCCACCGCGAACCACCCTCCTCCCTCCAGCTCGTCTCCCCCCACCACCTCCACCTCCACCACCACCTCCAAAGTCAAACCGAACCCGGTTCTGGGTCCGGCCCAGCCCCACCCCATGGTCCATTAATGGGCTCCATCTCCCTCCAACAACCAAGAAACTTAGCCCACTCCCCTTCCTCCTCCTCCGCCACCACCACTGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793592.1
MEFMETHAKNQGANSNPNPDRHREPPSSLQLVSPHHLHLHHHLQSQTEPGSGSGPAPPHGPLMGSISLQQPRNLAHSPSSSSATTTAIVATANNSNSDENNNNNNTSATNKVAKKPSKDRHTKVDGRGRRIRMPALCAARVFQLTRELGHKSDGETIEWLLHQAEPAIIAATGTGTIPANFSTLNVSLRSSGTTISAPPSKSAPLFLGGGAGMLGFHHQLTSNSHFGQDPDENYLKKRFREDTSGATSPKPARTSVHDQE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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