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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003633`

染色体: Chr01 坐标: 54855063-54856789 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003633`
名称	SmilChr01G003633
描述	uncharacterized SmilChr01G003633
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	54855063 - 54856789 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010184`
GeneID	`131010184`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010184`
原始查询	`LOC131010184`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0704400; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os06g0704400; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G05850` (MUG7) MuDR family transposase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3768859] identity=25.6; qcov=0.589; evalue=1.95e-22; confidence=low
Rice	`Os06g0704400` - identity=32.3; qcov=0.794; evalue=1.24e-43; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF26130 (PB1-like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010184

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057793597.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793597.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057793597.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057793597.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057793597.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:54855206`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C66
`Chr1:54855206`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C66
`Chr1:54855207`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B81
`Chr1:54855208`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	4	B20,B36,C67,C69
`Chr1:54855208`	`TA`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	4	B20,B36,C67,C69
`Chr1:54855622`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A21
`Chr1:54855772`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C67
`Chr1:54855938`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B90
`Chr1:54855997`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B46
`Chr1:54855997`	`A`	`AG`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B46
`Chr1:54856201`	`G`	`GGA`	2bp_insertion	frameshift_variant	51	A1,A2,A21,A6,A7,A8,B10,B113,B114,B128,B13,B131,B132,B136,B139,B17,B34,B42,B43,B44,B46,B47,B58,B64,B65,B68,B7,B70,B72,B75,B76,B92,B93,B96,C13,C19,C28,C29,C3,C41,C47,C5,C56,C71,C76,C77,C81,C83,D10,D6,D7
`Chr1:54856203`	`T`	`TCG`	2bp_insertion	frameshift_variant	50	A11,A13,A21,A3,A7,A8,B1,B102,B103,B107,B112,B113,B119,B120,B128,B13,B16,B17,B18,B24,B28,B41,B42,B64,B72,B74,B77,B81,B85,B86,B9,B90,B93,B94,C11,C38,C47,C48,C51,C54,C60,C67,C68,C69,C70,C8,C84,C87,C9,D5

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793597.1

491 aa

246

491

PB1-like

PF26130 PB1-like 13-84 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793597.1`	Pfam	`PF26130`	PB1-like	Domain	13	84	4.2e-11	43.7	PB1-like domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937614.1
ATGGTTTATGTGGCCCAACAAAATTGTACGCTAGGGGGCAATTTTGTTGGTCGATTTGACTTTGATCAAGATAGATTTGGATTTCTAGATTTAGAAGAGGAAATCCAAAAGCTGGGGTATGTTTCTTGGAAACGATTAGTCTACAAAGTACCAAGACTTGAAGTGTTTAAAAGCCTTAAGGATGATAAAGATGTGATGCAAATGCTATCACATGTTTCTAATGGAAATGAAGTGCTTCATATATATGTTGATGGTGGGAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131010184
ATGGTTTATGTGGCCCAACAAAATTGTACGCTAGGGGGCAATTTTGTTGGTCGATTTGACTTTGATCAAGATAGATTTGGATTTCTAGATTTAGAAGAGGAAATCCAAAAGCTGGGGTATGTTTCTTGGAAACGATTAGTCTACAAAGTACCAAGACTTGAAGTGTTTAAAAGCCTTAAGGATGATAAAGATGTGATGCAAATGCTATCACATGTTTCTAATGGAAATGAAGTGCTTCATATATATGTTGATGGTGGGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793597.1
MVYVAQQNCTLGGNFVGRFDFDQDRFGFLDLEEEIQKLGYVSWKRLVYKVPRLEVFKSLKDDKDVMQMLSHVSNGNEVLHIYVDGGKKVEGNVDDNKLQNESNGGEENDSEYVFSDGEEVTDDNMSAEVLYSEDDEYLEAIKSVRGNSTKGILDDVLGFSTGEGGFSDYENSDEDIYSSSTDDEGERFRQKIKRIVYDPKCDHKNLRITIGMKFQDGYQAREALKTNAIENGWQIHFKRVTKNQMEAYCTSPCKWRCYGS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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