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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003195`

染色体: Chr02 坐标: 53109246-53112473 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003195`
名称	SmilChr02G003195
描述	eugenol synthase 1-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	53109246 - 53112473 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010185`
GeneID	`131010185`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010185`
原始查询	`LOC131010185`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	eugenol synthase 1-like
产物	eugenol synthase 1-like
Arabidopsis	`AT1G75280` (AT1G75280) NmrA-like negative transcriptional regulator family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843865] identity=43.2; qcov=0.987; evalue=1.25e-86; confidence=medium
Rice	`Os12g0263200` - identity=43.3; qcov=1; evalue=7.92e-88; confidence=medium
GO	GO:0016491 (oxidoreductase activity)
KEGG	-
Pfam	PF01073 (3Beta_HSD); PF01370 (Epimerase); PF05368 (NmrA); PF13460 (NAD_binding_10)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010185

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057793593.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057793593.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057793593.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793593.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057793593.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:53109547`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B18,C70
`Chr2:53109820`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B1,B121,B130,B54,C80
`Chr2:53109840`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A23,B51,C85
`Chr2:53109894`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B10
`Chr2:53109987`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B32
`Chr2:53110140`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A23,C12,D11
`Chr2:53110173`	`TTG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	B100,B35
`Chr2:53110173`	`TTG`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	2	B100,B35
`Chr2:53110249`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A23,D11
`Chr2:53110274`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A23
`Chr2:53110297`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B102,B78,B95,C14,C83
`Chr2:53112092`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793593.1

314 aa

157

314

NmrA

Epimerase

3Beta_HSD

NAD_binding_10

PF05368 NmrA 5-295 aa PF01370 Epimerase 8-88 aa PF01073 3Beta_HSD 9-88 aa PF13460 NAD_binding_10 12-148 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793593.1`	Pfam	`PF05368`	NmrA	Family	5	295	8.8e-56	190.4	NmrA-like family
`XP_057793593.1`	Pfam	`PF01370`	Epimerase	Family	8	88	1.3e-07	32.0	NAD dependent epimerase/dehydratase family
`XP_057793593.1`	Pfam	`PF01073`	3Beta_HSD	Family	9	88	2.9e-05	24.0	3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family
`XP_057793593.1`	Pfam	`PF13460`	NAD_binding_10	Domain	12	148	4.5e-11	43.7	NAD(P)H-binding

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937610.1
TCACTTCATCAAGGAAATAACAGAAAAAAAGAGAAAACAAAAGGTAGTTGCTAGAAATCAAAGAAGAGTTGGAATTGCAATGAAACAAAATGAGAGCAGAATCCTCATATTTGGTGGAACAGGATACATAGGCAGCTACATGGTGAAGGCAAGCATCAAATTAGGACATCCCACTTATGTGTTTACGAGGCCAGATTCCAACAAGACAGACATCCTCACCGAGTTCCAATCCATGGGAGCGATCATAGTCAAAGGAAGAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131010185
ATGAAACAAAATGAGAGCAGAATCCTCATATTTGGTGGAACAGGATACATAGGCAGCTACATGGTGAAGGCAAGCATCAAATTAGGACATCCCACTTATGTGTTTACGAGGCCAGATTCCAACAAGACAGACATCCTCACCGAGTTCCAATCCATGGGAGCGATCATAGTCAAAGGAAGAGTCGATGAGCACGACAAGCTTGTTGCAGCGGTGAGGGAAGTCGACGTGGTGATATCCGCGTTGGCGTACCCGCAAGTTCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793593.1
MKQNESRILIFGGTGYIGSYMVKASIKLGHPTYVFTRPDSNKTDILTEFQSMGAIIVKGRVDEHDKLVAAVREVDVVISALAYPQVLDQLKILEAIKIAGNIKRFLPSDFGLEEDRVSALPPFEAFLNKKRRIRRAIEEAKIPYTFVSANCFGAYFINYLLHPSHPNKQDITVYGSGEAKAVLIYEEDIGIYTIKVATDPRTCNRVVVYRPPANVVSQLDLISLWEKKTGRFLNKTHITEQEIVTLSQSLPDPENIPVSI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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