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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003208`

染色体: Chr02 坐标: 53241287-53244838 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003208`
名称	SmilChr02G003208
描述	uncharacterized SmilChr02G003208
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	53241287 - 53244838 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010187`
GeneID	`131010187`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010187`
原始查询	`LOC131010187`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	CAK1; symbol=CAK1; hit=Os06g0171700; species=rice; confidence=high
产物	CAK1; symbol=CAK1; hit=Os06g0171700; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT4G30820` (AT4G30820) cyclin-dependent kinase-activating kinase assembly factor-related / CDK-activating kinase assembly factor-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829205] identity=50.5; qcov=1; evalue=3.26e-48; confidence=medium
Rice	`Os06g0171700` (CAK1) - identity=57.4; qcov=1.04; evalue=5.27e-68; confidence=high
GO	GO:0000079 (regulation of cyclin-dependent protein serine/threonine kinase activity); GO:0005675 (transcription factor TFIIH holo complex); GO:0006281 (DNA repair); GO:0006357 (regulation of transcription by RNA polymerase II)
KEGG	smil03022 (Basal transcription factors - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil03420 (Nucleotide excision repair - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF06391 (MAT1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010187

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057793596.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057793596.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057793596.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793596.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057793596.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:53242899`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A5,B124,B27,C25,C41
`Chr2:53242952`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr2:53242966`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A7,C81
`Chr2:53243149`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B70,D8
`Chr2:53244043`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B1,B100,D4
`Chr2:53244150`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B70,D8
`Chr2:53244184`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B107

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793596.1

189 aa

189

MAT1

PF06391 MAT1 12-89 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793596.1`	Pfam	`PF06391`	MAT1	Family	12	89	2.8e-30	106.4	CDK-activating kinase assembly factor MAT1

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937613.1
CTTCTTCCAAAGGCATCAGTCACGCTTCTTCCTCACTTTGAAATCCCTAAATCCCTAACCCTTCTCAAAAGCAACAGTCGCGCCGCCCACCACCCTCCTCCGCCACCATCTCCGCCGGAAATCAGTCTCCTGCAGACCGCCGCAATCTCCGCCCTTGCTGTGAAGTCGCCGCTGCCGCCGTCCCTAAATCCCTAACAGTCGCGCCGCCCACCACCCTCCTCCGCCACCATCTCCGCCGGAAATCAGTCTTCTGCAGACCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131010187
ATGGTGGTGGCCTCTACAGCAAACGCCTTCGCTAAGGAAATGAGCATCAGAAAAAGAATTGCCAGCATATACAATAAAAGAGAAGAGGACTTCCCATCGTTGCGCGAATACAATGACTACTTGGAAGAGGTAGAAGATATGATAATTAATTTAGTTGAGGGGATCGATGTCCCTGCTATCGAAGCAAGAATTGCTGAGTACCAGAGAGAGAATGCTGAGCAGATCATGAACGCCCAAGCTCGCAAGGCTGAGGAATATGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793596.1
MVVASTANAFAKEMSIRKRIASIYNKREEDFPSLREYNDYLEEVEDMIINLVEGIDVPAIEARIAEYQRENAEQIMNAQARKAEEYASALAASKGQLQPTGIDLSSSSQAGTSNVPQGQYAPAVAGGIAQPRPMGIPNPLGSGHDMMGLEYEDEETMRIRVEKAARAGGWSFEISKKRALEEAFASIWV

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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