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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003634`

染色体: Chr01 坐标: 54856830-54858072 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003634`
名称	SmilChr01G003634
描述	uncharacterized SmilChr01G003634
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	54856830 - 54858072 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010195`
GeneID	`131010195`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010195`
原始查询	`LOC131010195`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0704400; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os06g0704400; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT1G06740` (MUG3) MuDR family transposase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3766669] identity=25.4; qcov=0.769; evalue=2.3e-20; confidence=low
Rice	`Os06g0704400` - identity=31.1; qcov=0.785; evalue=6.4e-36; confidence=low
GO	GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF04434 (SWIM)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010195

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057793599.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057793599.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793599.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057793599.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057793599.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:54856959`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C35
`Chr1:54857408`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A23,B136,C11,C20,D10
`Chr1:54857453`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C11,C20,D10
`Chr1:54857465`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C87
`Chr1:54857467`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B33
`Chr1:54857476`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B108,B22,B36,B81,C79

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793599.1

307 aa

154

307

SWIM

PF04434 SWIM 111-149 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793599.1`	Pfam	`PF04434`	SWIM	Domain	111	149	1e-08	35.2	SWIM zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937616.1
ATGGAGAAGGAAAATGCTGTAGCTCATGAAGATTTCATAGGAAGAGATCCTAAGAAATTTTGTAAGGCATTCATTGAACCTGCTGTAGTTTGTGATATGATTCTGAATAATGTTAGTGAAACCTTCAATGGTTATATACTTAATGCCAGAGGAAAGCATTTGATTCACATGTTGGAGGAGATTAGAACATCTCTAATGGAGAGGCAATATAGGAAATTGGAAGAGGTGAGGGGCAACAATGATTTACTATGTCCATCTAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131010195
ATGGAGAAGGAAAATGCTGTAGCTCATGAAGATTTCATAGGAAGAGATCCTAAGAAATTTTGTAAGGCATTCATTGAACCTGCTGTAGTTTGTGATATGATTCTGAATAATGTTAGTGAAACCTTCAATGGTTATATACTTAATGCCAGAGGAAAGCATTTGATTCACATGTTGGAGGAGATTAGAACATCTCTAATGGAGAGGCAATATAGGAAATTGGAAGAGGTGAGGGGCAACAATGATTTACTATGTCCATCTAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793599.1
MEKENAVAHEDFIGRDPKKFCKAFIEPAVVCDMILNNVSETFNGYILNARGKHLIHMLEEIRTSLMERQYRKLEEVRGNNDLLCPSIRKKLDKLNMDSRFCITHPALGGKFEVDLNEDRFVVDVGTRSCTCRQWDITGIPCPHGCAVINFLKEDVAGYVHEYYSLAKYKDAYAYGLPPLNGEKMWPRAEGYPVKPPLVKKMPGRPKKKRKRDPLETNPSNSNRLRKICKMTCQKCFQQGHNSRGCKNQPIEKPTATQGKR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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