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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003220`

染色体: Chr02 坐标: 53422811-53424459 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003220`
名称	SmilChr02G003220
描述	myb-related protein 330
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	53422811 - 53424459 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010205`
GeneID	`131010205`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010205`
原始查询	`LOC131010205`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	myb-related protein 330
产物	myb-related protein 330
Arabidopsis	`AT1G22640` (MYB3) myb domain protein 3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838870] identity=54.9; qcov=1.16; evalue=4.01e-90; confidence=high
Rice	`Os05g0429900` (R2R3-MYB) - identity=57.5; qcov=1.11; evalue=4.83e-89; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00249 (Myb_DNA-binding); PF13921 (Myb_DNA-bind_6)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010205

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057793604.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793604.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057793604.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057793604.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057793604.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:53423106`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr2:53423281`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B35,C8
`Chr2:53423287`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C54
`Chr2:53423394`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C2,C32,C68
`Chr2:53423853`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B41,B59,C45

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793604.1

222 aa

111

222

Myb_DNA-binding

Myb_DNA-bind_6

Myb_DNA-binding

Myb_DNA-bind_6

PF00249 Myb_DNA-binding 14-61 aa PF13921 Myb_DNA-bind_6 17-75 aa PF00249 Myb_DNA-binding 67-111 aa PF13921 Myb_DNA-bind_6 70-116 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793604.1`	Pfam	`PF00249`	Myb_DNA-binding	Domain	14	61	4.7e-37	126.6	Myb-like DNA-binding domain
`XP_057793604.1`	Pfam	`PF13921`	Myb_DNA-bind_6	Domain	17	75	1.1e-22	80.6	Myb-like DNA-binding domain
`XP_057793604.1`	Pfam	`PF00249`	Myb_DNA-binding	Domain	67	111	4.7e-37	126.6	Myb-like DNA-binding domain
`XP_057793604.1`	Pfam	`PF13921`	Myb_DNA-bind_6	Domain	70	116	1.1e-22	80.6	Myb-like DNA-binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937621.1
AGCACATCACATTGCCAACTGATCTGTTAAAGTGTACCTACTCACCCAATCCAACCCCATCCATTAACAACTTGTCTTGCTCACCAACTTGGTCAAATCCATCTCTCTCTTCCCCATTTCTGTTACACACACACATATATATAATATGTATAGATCATATTCTTCATTTCTCACTATAAATGACCATCACTATTTCCATCTCTTTCTTTCATTTCTTCTTAAATCATCATCAAGAAGCGTAGTCCTATAACAAGATCTTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131010205
ATGGGGCGATCGCCTTGCTGTGAAAAAGCACACACGAACAAGGGTGCTTGGACTAAAGAAGAAGACCAGCGCCTAATCAGCTACATCCGCGCTCACGGCGAGGGCTGCTGGCGTTCCCTTCCTAAATCTGCAGGATTATTGAGATGCGGCAAAAGCTGCAGATTGAGATGGATAAACTATCTGAGGCCTGATCTCAAAAGAGGCAATTTCACTGAAGAAGAAGATGAAGTCATTATTAAATTGCACAGCTTGCTTGGAAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793604.1
MGRSPCCEKAHTNKGAWTKEEDQRLISYIRAHGEGCWRSLPKSAGLLRCGKSCRLRWINYLRPDLKRGNFTEEEDEVIIKLHSLLGNKWSLIAGRLPGRTDNEIKNYWNTHIKRKLLRRGMDPHTHRQINNRSPTPPPPPEQNNSSSADNSTTTTAEEDGGLDLDLSIGIRPSHPNYIKTASFNSPPEVRAMCVCWQLGFGKGQLCINCQSYNGFIHLLTNN

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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