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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003239`

染色体: Chr02 坐标: 53663442-53668441 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003239`
名称	SmilChr02G003239
描述	protein NRT1/ PTR FAMILY 5.10-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	53663442 - 53668441 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010219`
GeneID	`131010219`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010219`
原始查询	`LOC131010219`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein NRT1/ PTR FAMILY 5.10-like
产物	protein NRT1/ PTR FAMILY 5.10-like
Arabidopsis	`AT1G22540` (AT1G22540) Major facilitator superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838860] identity=63.5; qcov=0.96; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0871500` - identity=52.4; qcov=0.995; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0016020 (membrane); GO:0042937 (tripeptide transmembrane transporter activity); GO:0042938 (dipeptide transport); GO:0055085 (transmembrane transport); GO:0071916 (dipeptide transmembrane transporter activity)
KEGG	-
Pfam	PF00854 (PTR2); PF07690 (MFS_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010219

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057793623.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057793623.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793623.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057793623.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057793623.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:53663579`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B45,C26
`Chr2:53663581`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B139,B4,B97,C4
`Chr2:53663606`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41
`Chr2:53663624`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A4,B14,B94,C20,C79
`Chr2:53663683`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B107,B40,B55,C47,C8
`Chr2:53667009`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr2:53667021`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B35
`Chr2:53667061`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B35
`Chr2:53667244`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A7,C81
`Chr2:53667312`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr2:53667533`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B65,C40,C55,C71,C85
`Chr2:53667548`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A5,B124,B27,C25

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793623.1

568 aa

284

568

MFS_1

PTR2

PF07690 MFS_1 74-508 aa PF00854 PTR2 111-527 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793623.1`	Pfam	`PF07690`	MFS_1	Family	74	508	1.9e-09	37.6	Major Facilitator Superfamily
`XP_057793623.1`	Pfam	`PF00854`	PTR2	Family	111	527	5.4e-86	289.6	POT family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937640.1
AAATCTCTTTTATGCAGTTGTGTTACGTATAATAATAACTTTAACTATTTAAGTAGAGACAACAACCTATTAGCAAACCCAGAATCTAGAGAGAGAAAATGGGAAGTACTACTGCGATCGCCGGAAACGGCGTATCTGACGCAGAAGCTGCTTTGCTGAACGACGCCGTAGGCGCTGCCACTGACTTCCGAGGTCGACCGGCGAGCCGGTCGAGAACCGGCAGATGGAAATCCGCTTCTTTCATCATCGGTGTTGAAGTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131010219
ATGGGAAGTACTACTGCGATCGCCGGAAACGGCGTATCTGACGCAGAAGCTGCTTTGCTGAACGACGCCGTAGGCGCTGCCACTGACTTCCGAGGTCGACCGGCGAGCCGGTCGAGAACCGGCAGATGGAAATCCGCTTCTTTCATCATCGGTGTTGAAGTGGCGGAGAGATTTGCGTATTATGGAATAAGCTCGAATTTGATAAACTATTTGACGGGGCCGATGGGGCAATCGACGGCGGCGGCGGCGGAGAACGTCAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793623.1
MGSTTAIAGNGVSDAEAALLNDAVGAATDFRGRPASRSRTGRWKSASFIIGVEVAERFAYYGISSNLINYLTGPMGQSTAAAAENVNAWNGTATLLPLLGAFVADSFLGRFRTIVVASVLYVVSLGLLSMSAAFHSSNSSHCKTNANNPVCSPPSLEVVIFFFSLYLVAVAQGGHKPCVQAFGADQFDDEDEEELIAKSSFFNWWYFSMNIGILAALSVLSYIQENLSWGLGFGIPCIFMCFALFVFLLGSTTYRFLLSS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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