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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003233`

染色体: Chr02 坐标: 53600462-53601925 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003233`
名称	SmilChr02G003233
描述	uncharacterized SmilChr02G003233
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	53600462 - 53601925 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010225`
GeneID	`131010225`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010225`
原始查询	`LOC131010225`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os12g0597300; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os12g0597300; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT1G06740` (MUG3) MuDR family transposase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3766669] identity=31.4; qcov=0.678; evalue=2.02e-11; confidence=low
Rice	`Os12g0597300` - identity=34.6; qcov=0.694; evalue=1.39e-14; confidence=low
GO	GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF04434 (SWIM)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010225

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057793631.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793631.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057793631.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057793631.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057793631.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:53601009`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A22,B127,B23
`Chr2:53601010`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B72,C74
`Chr2:53601052`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	4	A18,B115,B59,C45
`Chr2:53601052`	`CT`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	4	A18,B115,B59,C45
`Chr2:53601062`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	73	A1,A15,A18,A22,A4,A5,A6,B111,B112,B120,B122,B123,B128,B131,B14,B19,B20,B25,B27,B30,B31,B32,B35,B36,B37,B41,B42,B43,B44,B45,B46,B49,B51,B56,B58,B6,B60,B62,B63,B64,B65,B67,B75,B77,B78,B79,B81,B82,B83,B96,C1,C11,C18,C20,C26,C29,C35,C40,C42,C43,C47,C5,C6,C63,C69,C76,C78,C79,C82,C83,C9,D8,D9
`Chr2:53601089`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	D7
`Chr2:53601089`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	D7
`Chr2:53601219`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr2:53601236`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A23,B69,B72
`Chr2:53601255`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A11,B11,B14,C55,C85
`Chr2:53601278`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A18,B115,B17,B59,C45
`Chr2:53601307`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	10	A22,B109,B118,B127,B130,B136,B139,B23,B7,C61

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793631.1

183 aa

183

SWIM

PF04434 SWIM 15-46 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793631.1`	Pfam	`PF04434`	SWIM	Domain	15	46	4.7e-05	23.5	SWIM zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937648.1
GTACCATAATTGTGTGAAAAGAAAACAAAATTAAATTAATTATACCATAAAATATAATAAATCACAAAATCTCCCGTGCAACATTCGATTTTCCCTATCTCTTCTGAACCTCAATGTCATTTTCTCCTCTTTGTTCCACCTCACCAACCCATCCTTCAAAATTCACCAGCTCTCCATCGATTTCCATGACATAAACTTACTCCAAATGTCTCAAAAATATTGGAGATAAATGTGATGGCTAGTGCATCCTGCATAGCACT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131010225
ATGATGCCTTCCAGGTGCATTATGAAGGTATCAACCTTTGTTGTGTATGTGAAAACAAACATGAATGGGCAAAACAAGTGTTCATGCCTGGAATGTTATATAAGTGGTATCCCTTGCAAGCATGCTTGCGCTGCCATCAGATTCATGGATCGTGATCCCACTGATTTTGTTTCTGGTTACTTCACTATGGCTACCTATCTTTCGGGGTATGAATTTGGTATCAAACGTATTGTTGGGAACAAGATGTGGCCTGAAGTGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793631.1
MMPSRCIMKVSTFVVYVKTNMNGQNKCSCLECYISGIPCKHACAAIRFMDRDPTDFVSGYFTMATYLSGYEFGIKRIVGNKMWPEVKSDVVKPPPKTRMAGCPKKKRVRAPQEKEWRMTRHVVVMSCSKCKQTEHNKRKCSNPALENPNPNKAFKGWCTSKRKQGKRRRQIQPRYFVKEKGCI

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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