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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003248`

染色体: Chr02 坐标: 53743126-53744765 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003248`
名称	SmilChr02G003248
描述	cytosolic sulfotransferase 12-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	53743126 - 53744765 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010230`
GeneID	`131010230`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010230`
原始查询	`LOC131010230`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	cytosolic sulfotransferase 12-like
产物	cytosolic sulfotransferase 12-like
Arabidopsis	`AT3G45070` (AT3G45070) P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823642] identity=42.6; qcov=0.95; evalue=1.51e-79; confidence=medium
Rice	`Os12g0137700` - identity=41.6; qcov=0.837; evalue=9.9e-68; confidence=medium
GO	GO:0005737 (cytoplasm); GO:0008146 (sulfotransferase activity); GO:0051923 (sulfation)
KEGG	-
Pfam	PF00685 (Sulfotransfer_1); PF13469 (Sulfotransfer_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010230

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057793639.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057793639.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057793639.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793639.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057793639.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:53743423`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41
`Chr2:53743454`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A10,B61,C58
`Chr2:53743494`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B11,B14,B35,C55,C85
`Chr2:53743522`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B49,B60,B64,B79
`Chr2:53743607`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B10
`Chr2:53743620`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C54
`Chr2:53743650`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr2:53743739`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41
`Chr2:53743771`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B41,C28
`Chr2:53743786`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C75
`Chr2:53743786`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C75
`Chr2:53743804`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793639.1

319 aa

160

319

Sulfotransfer_1

Sulfotransfer_3

PF00685 Sulfotransfer_1 62-314 aa PF13469 Sulfotransfer_3 151-245 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793639.1`	Pfam	`PF00685`	Sulfotransfer_1	Domain	62	314	8.5e-66	222.7	Sulfotransferase domain
`XP_057793639.1`	Pfam	`PF13469`	Sulfotransfer_3	Domain	151	245	3.4e-08	34.7	Sulfotransferase family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937656.1
TTGCTGATGCCAAATACTCATTTAAGGTCCCTAACATTTTGGCTAAGGATCCACTAGCAACAGGTGCATTTATTTTTTATTTGTACACGAAATTGTTTCATTATTCTTTCACAGTTTATACGTTTCGAAAATTGGCATATATCTCCGATGACAACACTATGACATTGATATATATTCATATTTTAATACTTACTTTAATGAGCGATGTAACCTTTTGTAAATTAAATCTCTTAAGATCAATTTTAATTTATGAAATGATT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131010230
ATGCAGAAATCTGTTGAATCTCCAACTAAAATGGTGTCTACCACCGAAGATAATGAGGTGGAGATGGAGGTACCAAAAGCGCGGTTTTGGGATGCAATGGACATCACCCAATGGGAAGGCTTTTGGTTCGGGCCAGGCCTGTTGAAGCCCGCCTTCACATTCCGGTCGAGCTTCCACGCCCGGGATGATGACGTAATCCTCGCATCAACCATGAAAACGGGCACCACGTGGCTTAAGTCACTCTCTCTCTGCATCTTAAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793639.1
MQKSVESPTKMVSTTEDNEVEMEVPKARFWDAMDITQWEGFWFGPGLLKPAFTFRSSFHARDDDVILASTMKTGTTWLKSLSLCILKNRDDPKHDMLAMENPHFHVPTIESTLYSTKPLHVDIYDASGPRLLHTHLPHAVLPDSIKESGCKVVYMARNPKDTLISMWHFFNSFLRPDREPFPLEKAVDCFCSGLHQYGPFSNHVAEYWLESRKRPHKILFVKYEEMKSDPKGQVSRIADFLGRPFGEEEQVDEVLWRCSL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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