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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003273`

染色体: Chr02 坐标: 54010463-54013641 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003273`
名称	SmilChr02G003273
描述	elongation factor 1-gamma 2-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	54010463 - 54013641 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010258`
GeneID	`131010258`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010258`
原始查询	`LOC131010258`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	elongation factor 1-gamma 2-like
产物	elongation factor 1-gamma 2-like
Arabidopsis	`AT1G09640` (AT1G09640) Translation elongation factor EF1B, gamma chain [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837491] identity=74.3; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0220500` - identity=74.5; qcov=1.04; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0003746 (translation elongation factor activity); GO:0004364 (glutathione transferase activity); GO:0006414 (translational elongation)
KEGG	-
Pfam	PF00043 (GST_C); PF00647 (EF1G); PF02798 (GST_N); PF13409 (GST_N_2); PF13417 (GST_N_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010258

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057793678.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057793678.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057793678.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793678.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057793678.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:54011665`	`AAG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	B109,B70
`Chr2:54011665`	`AAG`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	2	B109,B70
`Chr2:54012407`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C53
`Chr2:54012439`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B106,B73
`Chr2:54012640`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B107,B8
`Chr2:54012661`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C71
`Chr2:54013023`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr2:54013025`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B63
`Chr2:54013168`	`TGC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	68	A1,A11,A13,A2,A22,A3,B103,B106,B11,B121,B123,B128,B129,B135,B16,B17,B19,B2,B21,B24,B26,B33,B34,B41,B45,B49,B54,B55,B60,B61,B62,B67,B70,B72,B73,B76,B78,B79,B82,C13,C15,C24,C30,C31,C35,C36,C39,C43,C44,C45,C48,C52,C56,C57,C58,C59,C6,C63,C7,C70,C71,C72,C73,C8,C83,D2,D5,D6
`Chr2:54013171`	`A`	`AAC`	2bp_insertion	frameshift_variant	48	A1,A11,A13,A2,B103,B106,B11,B128,B129,B17,B19,B2,B21,B34,B41,B45,B49,B54,B55,B60,B61,B62,B67,B70,B72,B76,B78,B79,C13,C30,C31,C36,C43,C45,C48,C56,C57,C58,C59,C6,C63,C7,C70,C71,C72,C73,C83,D5
`Chr2:54013264`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A8,B104,C33
`Chr2:54013339`	`G`	`GT`	1bp_insertion	stop_gained,frameshift_variant	27	A10,A23,A8,B12,B122,B124,B136,B140,B15,B2,B20,B30,B48,B55,B58,B64,B66,B91,C16,C28,C4,C46,C51,C54,C64,C66,D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793678.1

416 aa

208

416

GST_N

GST_N_3

GST_N_2

GST_C

EF1G

PF02798 GST_N 12-75 aa PF13417 GST_N_3 12-79 aa PF13409 GST_N_2 13-75 aa PF00043 GST_C 127-196 aa PF00647 EF1G 255-363 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793678.1`	Pfam	`PF02798`	GST_N	Domain	12	75	1.2e-12	48.7	Glutathione S-transferase, N-terminal domain
`XP_057793678.1`	Pfam	`PF13417`	GST_N_3	Domain	12	79	4.3e-06	27.7	Glutathione S-transferase, N-terminal domain
`XP_057793678.1`	Pfam	`PF13409`	GST_N_2	Domain	13	75	1.5e-07	32.6	Glutathione S-transferase, N-terminal domain
`XP_057793678.1`	Pfam	`PF00043`	GST_C	Domain	127	196	2.9e-09	37.8	Glutathione S-transferase, C-terminal domain
`XP_057793678.1`	Pfam	`PF00647`	EF1G	Domain	255	363	1.3e-43	147.9	Elongation factor 1 gamma, conserved domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937695.1
GAAAATAAATCAATTTGACGCGGAATCCCTAAAATGCCCATGAAATCGTAAGTAAATGCGGCATATTCCCTTCCAAAATGGGTACCCCTGGAGCACCATAACAAAAACAAACTATATATCTACCGCAAGAAACCCTAAACCTTCCCTCTCTCACATATCCTCTCTCACTAAAGCCTCAGCTGCGGTTTCATCTCACTCTGCAGATTCATTGAATTGCGAGAGTGATTAATTGGATCCTGTGAAGCCATGGCTCTGGTTTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131010258
ATGGCTCTGGTTTTGCATTCTACTGCAAACAAAAATACACAGAAGACACTTATTGTGTCTGAGTTCAATGGTGTAAAGGTCGAATTAGCTAAGGATTTTCAGATGGGTGTAACAAATAAAACCCCAGAATTTATCAAGATGAATCCCATCGGAAAGATACCTGTGCTCGAAACGCCTGATGGCCCGATATTTGAGAGCAATGCTATTGCCCGCTACGTGGCTCGTTTAAATCCCGACAGCAACCTATTTGGCTCTTCCCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793678.1
MALVLHSTANKNTQKTLIVSEFNGVKVELAKDFQMGVTNKTPEFIKMNPIGKIPVLETPDGPIFESNAIARYVARLNPDSNLFGSSPFEYGQVEQWIDFSTNEIDAHIGGWFYPRLGIRAYLPPVEEAAIASLKRGLAALNTHLASHTYLVGHSVTLADIITVCNLSIGFKAILIKSFTSEFPHVERYFWTLVNQPNFKKVLGDIKQAESVPPVATKKHGQPKEAAKPKPKEEPKKEAKKEEPKAVEEEEAPKPKAKNPL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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