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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003274`

染色体: Chr02 坐标: 54018944-54021254 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003274`
名称	SmilChr02G003274
描述	biogenesis of lysosome-related organelles complex 1 subunit 2
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	54018944 - 54021254 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010259`
GeneID	`131010259`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010259`
原始查询	`LOC131010259`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	biogenesis of lysosome-related organelles complex 1 subunit 2
产物	biogenesis of lysosome-related organelles complex 1 subunit 2
Arabidopsis	`AT5G49550` (BLOS2) biosis of lysosome organelles complex 1 subunit-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835016] identity=65.5; qcov=0.902; evalue=1.69e-45; confidence=medium
Rice	`Os02g0190900` - identity=62.2; qcov=0.975; evalue=1.65e-48; confidence=medium
GO	-
KEGG	smil04142 (Lysosome biogenesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF10046 (BLOC1_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010259

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057793679.1`
2	Cytoplasmic vesicle	细胞质囊泡	0.40000	`XP_057793679.1`
3	Spindle	Spindle	0.40000	`XP_057793679.1`
4	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057793679.1`
5	Chromosome	染色体	0.20000	`XP_057793679.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:54019112`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A11,B87,C46,C50
`Chr2:54019195`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A10,B61,C58
`Chr2:54019788`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A23,B51,C85

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793679.1

122 aa

122

BLOC1_2

PF10046 BLOC1_2 18-111 aa

XP_057793680.1

122 aa

122

BLOC1_2

PF10046 BLOC1_2 18-111 aa

XP_057793681.1

122 aa

122

BLOC1_2

PF10046 BLOC1_2 18-111 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793679.1`	Pfam	`PF10046`	BLOC1_2	Coiled-coil	18	111	1e-25	90.6	Biogenesis of lysosome-related organelles complex-1 subunit 2
`XP_057793680.1`	Pfam	`PF10046`	BLOC1_2	Coiled-coil	18	111	1e-25	90.6	Biogenesis of lysosome-related organelles complex-1 subunit 2
`XP_057793681.1`	Pfam	`PF10046`	BLOC1_2	Coiled-coil	18	111	1e-25	90.6	Biogenesis of lysosome-related organelles complex-1 subunit 2

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937697.1
GTATAAACAGTGAGGTCCCAAATTCAAACATCACTGCTCCACCTCCCCGACCCCCCAAGTCAAAAAAAAATATCCATGGTCGCAATTGTGATCTAGTATATTAAATTGGGATATGGAGGGTGTAGTTAATTTGTCTATTTTATTATTTTTATTTTACCTTTATAATTTTTGTATTTCTGTAATATTCAAAAATCAAAACTCTGACAATAATCCGAACTCCACATAGATTTCCAATCCAGTCTCCAATCTGATCACAGCTC...

XM_057937696.1
TAGTATATTAAATTGGGATATGGAGGGTGTAGTTAATTTGTCTATTTTATTATTTTTATTTTACCTTTATAATTTTTGTATTTCTGTAATATTCAAAAATCAAAACTCTGACAATAATCCGAACTCCACATAGATTTCCAATCCAGTCTCCAATCTGATCACAGCTCACAGGAAACGAGAATCCTTAGATTTATTGCGCCGCTCGCCGTTGCCGCCCATCAACCCTGCAGCGACGCTAGTAACTGTCACGAGATCACCCG...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC131010259
ATGGCTTCTGGAAAGGATACAGAGCAAGACTTACTCGCCGCTTCTCTAAATGATCTTTTCACCAATGTCTCCGACATGATCAAAGGCGAGCTCCAGGGAACAAATAACGTGCTCGAGCTTTTGGAGAAAATGAATGTTAGAGTGGGAGAAGAATACAAAGGCTTCGGTGATGTGGCCTCAGGATTAAGAGTTTTTGTCGAGCAATTGAAGTCGAAAAGCTGCACGTTCGACGACTGCGTTCAGCAGCTTGATGCCATAGA...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057793679.1
MASGKDTEQDLLAASLNDLFTNVSDMIKGELQGTNNVLELLEKMNVRVGEEYKGFGDVASGLRVFVEQLKSKSCTFDDCVQQLDAIEQHVMEFEAVISMLDRYVSLLESKMQQVYQIPPALK

XP_057793680.1
MASGKDTEQDLLAASLNDLFTNVSDMIKGELQGTNNVLELLEKMNVRVGEEYKGFGDVASGLRVFVEQLKSKSCTFDDCVQQLDAIEQHVMEFEAVISMLDRYVSLLESKMQQVYQIPPALK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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