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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003281`

染色体: Chr02 坐标: 54119649-54123277 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003281`
名称	SmilChr02G003281
描述	agamous-like MADS-box protein AGL12
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	54119649 - 54123277 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010263`
GeneID	`131010263`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010263`
原始查询	`LOC131010263`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	agamous-like MADS-box protein AGL12
产物	agamous-like MADS-box protein AGL12
Arabidopsis	`AT1G71692` (AGL12) AGAMOUS-like 12 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843497] identity=59; qcov=1.03; evalue=2.44e-71; confidence=high
Rice	`Os08g0112700` (MADS26) - identity=56.3; qcov=0.991; evalue=2.04e-74; confidence=high
GO	GO:0000978 (RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding); GO:0000981 (DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific); GO:0005634 (nucleus); GO:0045944 (positive regulation of transcription by RNA polymerase II); GO:0046983 (protein dimerization activity)
KEGG	-
Pfam	PF00319 (SRF-TF); PF01486 (K-box)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010263

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057793694.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793694.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057793694.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057793694.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057793694.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:54120127`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A11,B107,B29
`Chr2:54120836`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B11,C55
`Chr2:54120905`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C42
`Chr2:54121852`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B107,B29
`Chr2:54122958`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A24,B108,B5,B98

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793694.1

215 aa

108

215

SRF-TF

K-box

PF00319 SRF-TF 10-56 aa PF01486 K-box 86-176 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793694.1`	Pfam	`PF00319`	SRF-TF	Domain	10	56	8.2e-23	80.3	SRF-type transcription factor (DNA-binding and dimerisation domain)
`XP_057793694.1`	Pfam	`PF01486`	K-box	Family	86	176	2.9e-20	72.9	K-box region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937711.1
CCAACCATGAAAATGGTGGAGTTAATTTTTATTATTCTTCTTTTTTTGGAATAGAATCATGAGGGGTGTGTGTGTGTGCGCGTGTATATAAGGTTGTGTCAGTCGTGAGAGCAAGTGTGTGTGTGTTATTTTTGTTCAAGCACTCGAGCGAGTTTTAGAGAGAGAAAGGCAACAGTCTCGAAGCTAGTTCAAACTAGTGGGAGCTGCTTGTCTCTGCAAGCTTACAGCACTCATCAAAACAATTCATAACTTGAAATTTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131010263
ATGGCTCGAGGAAAGACTCAGATGAAGAGGATCGAGAATCCGGTGCATCGGCAGGTCACCTTCTGCAAGAGGCGCGCGGGGCTTCTGAAGAAGGCTAAGGAGCTGTCTGTGCTGTGTGATGCTGAGATTGGGCTCTTCATTTTCTCTGCCCATGGCAAGCTCTATGAACTTGCCACCAAAGGAAGCATGAAAGGTTTGATTGACAAATACACGAAGTATAGCAAGGAAATCCCAGCTGATGAAGAGCCTAAAGAGAAGCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793694.1
MARGKTQMKRIENPVHRQVTFCKRRAGLLKKAKELSVLCDAEIGLFIFSAHGKLYELATKGSMKGLIDKYTKYSKEIPADEEPKEKQANEYMELKEEINLLKNEIEILQKGIRYISGGGAPGAMTLNELNVLEKHLETWIYQVRSAKMDIMAQEILLLKNKEGILQAANKHLQEKIDEQYGMIELSPMLTNFQYPLTTNINQCPLTIPNQEIYQF

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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