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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003698`

染色体: Chr01 坐标: 55353220-55354596 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003698`
名称	SmilChr01G003698
描述	uncharacterized SmilChr01G003698
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	55353220 - 55354596 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010270`
GeneID	`131010270`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010270`
原始查询	`LOC131010270`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0597250; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os06g0597250; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT2G13770` (AT2G13770) nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815861] identity=41; qcov=0.67; evalue=2.24e-68; confidence=medium
Rice	`Os06g0597250` - identity=44.9; qcov=0.988; evalue=4.75e-121; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04827 (Plant_tran); PF13359 (DDE_Tnp_4); PF28509 (DUF8418)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010270

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057793708.1`
2	Chromosome	染色体	0.40000	`XP_057793708.1`
3	Telomere	端粒	0.20000	`XP_057793708.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057793708.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057793708.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:55353244`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	B19,B65,B73
`Chr1:55353244`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B19,B65,B73
`Chr1:55353256`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B5
`Chr1:55353259`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B14
`Chr1:55353262`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B67,C50
`Chr1:55353282`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C19,C46
`Chr1:55353284`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C69
`Chr1:55353288`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B48,B57
`Chr1:55353289`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B30,B63,B95,C4
`Chr1:55353296`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B67,C50
`Chr1:55353307`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C4
`Chr1:55353308`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B122,B14,B60

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793708.1

433 aa

216

433

DUF8418

DDE_Tnp_4

Plant_tran

PF28509 DUF8418 73-111 aa PF13359 DDE_Tnp_4 203-348 aa PF04827 Plant_tran 205-358 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793708.1`	Pfam	`PF28509`	DUF8418	Domain	73	111	7.1e-16	58.4	Domain of unknown function (DUF8418)
`XP_057793708.1`	Pfam	`PF13359`	DDE_Tnp_4	Domain	203	348	1.3e-07	32.1	DDE superfamily endonuclease
`XP_057793708.1`	Pfam	`PF04827`	Plant_tran	Family	205	358	1.2e-77	260.9	Plant transposon protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937725.1
ATGGCATCAAATGAAAACTTTGATGATTCCAGTCCTAGCTTTGATCCTTTCGATTACACCAAATTTGATGAAATGCATGAAAATCATGTATTACAAAATCGACGCATTGACTCCATGATCGATTATGTGGCTTTTCAGATTCCAACTCTATCTTTACAACCTACAAACAACACTGATAGAGCACCACGACGATTTATTGAACGTCGTCGTGAGCAAGGCCATGAAGGTGTGTTCGAGCAATACTTTTCAAACGATCCAAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131010270
ATGGCATCAAATGAAAACTTTGATGATTCCAGTCCTAGCTTTGATCCTTTCGATTACACCAAATTTGATGAAATGCATGAAAATCATGTATTACAAAATCGACGCATTGACTCCATGATCGATTATGTGGCTTTTCAGATTCCAACTCTATCTTTACAACCTACAAACAACACTGATAGAGCACCACGACGATTTATTGAACGTCGTCGTGAGCAAGGCCATGAAGGTGTGTTCGAGCAATACTTTTCAAACGATCCAAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793708.1
MASNENFDDSSPSFDPFDYTKFDEMHENHVLQNRRIDSMIDYVAFQIPTLSLQPTNNTDRAPRRFIERRREQGHEGVFEQYFSNDPIYTPEVFRTRFRMRKPLFERIMNKLVATDKFFQQKRDATGRLGMSSIQKCTAAMRVLAYGIGADLHDEYIRMSAQTIRKSVEKFVQGVVHNFGGEYLRRPTEEDLAYLLYVGAQRGFPGRSGKTTIILEAVASQDLWIWHAFFGTLGPRNDINVLHQSPVFSDILEGRAPKVSY...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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