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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003309`

染色体: Chr02 坐标: 54345754-54347729 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003309`
名称	SmilChr02G003309
描述	40S ribosomal protein S5-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	54345754 - 54347729 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010289`
GeneID	`131010289`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010289`
原始查询	`LOC131010289`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	40S ribosomal protein S5-like
产物	40S ribosomal protein S5-like
Arabidopsis	`AT2G37270` (RPS5B) ribosomal protein 5B [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818304] identity=82.8; qcov=0.943; evalue=1.08e-123; confidence=high
Rice	`Os11g0482000` (RPS5A) - identity=85.4; qcov=0.914; evalue=5.88e-124; confidence=high
GO	GO:0000028 (ribosomal small subunit assembly); GO:0003729 (mRNA binding); GO:0003735 (structural constituent of ribosome); GO:0005840 (ribosome); GO:0006412 (translation); GO:0019843 (rRNA binding); GO:0022627 (cytosolic small ribosomal subunit)
KEGG	smil03010 (Ribosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00177 (Ribosomal_S7)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010289

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057793724.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057793724.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793724.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057793724.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057793724.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:54346257`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B11,C54,C55
`Chr2:54346317`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B95,C14,C83
`Chr2:54346335`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr2:54346605`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A5,B124,C25
`Chr2:54346644`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B35,B63,B83
`Chr2:54346663`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793724.1

210 aa

105

210

Ribosomal_S7

PF00177 Ribosomal_S7 49-210 aa

XP_057793725.1

210 aa

105

210

Ribosomal_S7

PF00177 Ribosomal_S7 49-210 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793724.1`	Pfam	`PF00177`	Ribosomal_S7	Domain	49	210	4.5e-43	147.1	Ribosomal protein S7p/S5e
`XP_057793725.1`	Pfam	`PF00177`	Ribosomal_S7	Domain	49	210	4.5e-43	147.1	Ribosomal protein S7p/S5e

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937741.1
GCCCAAGCAATGATATCCGGCCCACAGGGTATAATTGTAATACCCATTAAACTGCACAATTGAATTAGCCCTAGGGTTTTACAAGCAGCTCTCATATTTATTTTCGTCTTCTTCGTCTCCACACACTCCATCACCGCAGATTTGCAGAGCTCCCCGCCCCCGCCGTACAGAAGCACAATGGAGGCCGCCGTCCCTGCCGTCGCAGTTGTAGATGAAGTCCAGGATAAGAGTCGCAGCGAGGTCATGCTCTTCAACCGGTG...

XM_057937742.1
ACAGGGTATAATTGTAATACCCATTAAACTGCACAATTGAATTAGCCCTAGGGTTTTACAAGCAGCTCTCATATTTATTTTCGTCTTCTTCGTCTCCACACACTCCATCACCGCAGATTTGCAGAGCTCCCCGCCCCCGCCGTACAGAAGCACAATGGAGGCCGCCGTCCCTGCCGTCGCAGTTGTAGATGAAGTCCAGGATAAGAGTCGCAGCGAGGTCATGCTCTTCAACCGGTGGTCCTACGACGGAGTTGAGGCAA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131010289
ATGGAGGCCGCCGTCCCTGCCGTCGCAGTTGTAGATGAAGTCCAGGATAAGAGTCGCAGCGAGGTCATGCTCTTCAACCGGTGGTCCTACGACGGAGTTGAGGTTAGTGACATTTCTGTTGAGGATTACATCACTGCAACTGCTTCAAAACGCCCTATATACATGCCCCACACTGCTGGGAGGTACCAAGCAAAGCGGTTCAGGAAGGCTCAGTGCCCAATTGTTGAAAGGCTGACCAACTCGCTCATGATGCACGGTAG...

LOC131010289
ATGGAGGCCGCCGTCCCTGCCGTCGCAGTTGTAGATGAAGTCCAGGATAAGAGTCGCAGCGAGGTCATGCTCTTCAACCGGTGGTCCTACGACGGAGTTGAGGCAAATGACATTTCTGTTGAGGATTACATCACTGCAACTGCTTCAAAACGCCCTATATACATGCCCCACACTGCTGGGAGGTACCAAGCAAAGCGGTTCAGGAAGGCTCAGTGCCCAATTGTTGAAAGGCTGACCAACTCGCTCATGATGCACGGTAG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057793724.1
MEAAVPAVAVVDEVQDKSRSEVMLFNRWSYDGVEVSDISVEDYITATASKRPIYMPHTAGRYQAKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIVKHAMEIIHLLTDQNPIQVIVDAVINSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGARESSFRNVKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIERVAKANR

XP_057793725.1
MEAAVPAVAVVDEVQDKSRSEVMLFNRWSYDGVEANDISVEDYITATASKRPIYMPHTAGRYQAKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIVKHAMEIIHLLTDQNPIQVIVDAVINSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGARESSFRNVKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIERVAKANR

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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