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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003355`

染色体: Chr02 坐标: 54721584-54723574 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003355`
名称	SmilChr02G003355
描述	protein NRT1/ PTR FAMILY 4.4
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	54721584 - 54723574 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010331`
GeneID	`131010331`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010331`
原始查询	`LOC131010331`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein NRT1/ PTR FAMILY 4.4
产物	protein NRT1/ PTR FAMILY 4.4
Arabidopsis	`AT1G33440` (AT1G33440) Major facilitator superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840237] identity=74.4; qcov=0.985; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os11g0235200` (SP1) - identity=66.2; qcov=1.06; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0016020 (membrane); GO:0022857 (transmembrane transporter activity); GO:0055085 (transmembrane transport)
KEGG	-
Pfam	PF00854 (PTR2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010331

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057793789.1`
2	Vacuole	液泡	0.40000	`XP_057793789.1`
3	Vacuole membrane	液泡膜	0.20000	`XP_057793789.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057793789.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793789.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:54721992`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B125,B61,C39,C65,D10
`Chr2:54722313`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41
`Chr2:54722370`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B101,B40,C22,C82
`Chr2:54722619`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D8
`Chr2:54722632`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44
`Chr2:54722733`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B125,C39,C65,D10
`Chr2:54722766`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C57
`Chr2:54722791`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B128
`Chr2:54722796`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C71
`Chr2:54722964`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B94
`Chr2:54723156`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr2:54723195`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B94

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793789.1

551 aa

276

551

PTR2

PF00854 PTR2 93-480 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793789.1`	Pfam	`PF00854`	PTR2	Family	93	480	6e-89	299.4	POT family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937806.1
AGCAGAGCAGAGCATATCTATTCTACTGATTGTGTTAAAAAGGGGAACATTCAAAAGCTAGCAGATTATAATTTGCATGGATATGGAACAAGAGTCCGAATCTGTTGACTGGAGAGGGAGACCTTCCAAACCCACTCGCCATGGCGGCATGACTGCTGCTCTCTTCGTCCTAGGGCTTCAAGGTTTCGAGATGATGGCAGTAGCTGCGGTGGGGAATAACCTCATCACATACGTCTTCAACGAGATGCACTTCCCTCTGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131010331
ATGGATATGGAACAAGAGTCCGAATCTGTTGACTGGAGAGGGAGACCTTCCAAACCCACTCGCCATGGCGGCATGACTGCTGCTCTCTTCGTCCTAGGGCTTCAAGGTTTCGAGATGATGGCAGTAGCTGCGGTGGGGAATAACCTCATCACATACGTCTTCAACGAGATGCACTTCCCTCTGTCCAAGGCCGCCAACACCGTCACCAACTTCGTGGGCACCATTTTCCTGCTCTCCCTCTTGGGCGGATTCCTCTCCGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793789.1
MDMEQESESVDWRGRPSKPTRHGGMTAALFVLGLQGFEMMAVAAVGNNLITYVFNEMHFPLSKAANTVTNFVGTIFLLSLLGGFLSDSYLGSFWTMLIFGFVELSGFILLSVQAHVPELRPSAFQEASGYKASIFYGALYLVALGSGCLKPNIISHGADQLGKHQSKNLSTFFNCAYFAFCTGELLALTLLVWVQTHSGMDVGFGVSAAAMAVGLICLISGSFAYRNTPPRGSIFTPIAQVFVAAISKRKQICPSNASTL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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