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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003325`

染色体: Chr02 坐标: 54519341-54523658 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003325`
名称	SmilChr02G003325
描述	uncharacterized SmilChr02G003325
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	54519341 - 54523658 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010352`
GeneID	`131010352`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010352`
原始查询	`LOC131010352`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	SNARE associated Golgi protein family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838890]; symbol=AT1G22850; hit=AT1G22850; species=arabidopsis; confidence=high
产物	SNARE associated Golgi protein family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838890]; symbol=AT1G22850; hit=AT1G22850; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G22850` (AT1G22850) SNARE associated Golgi protein family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838890] identity=79.5; qcov=0.859; evalue=8.76e-143; confidence=high
Rice	`Os01g0884900` - identity=87.3; qcov=0.418; evalue=1.19e-82; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF09335 (VTT_dom)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010352

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057793825.1`
2	Chloroplast membrane	叶绿体膜	1.00000	`XP_057793825.1`
3	Chloroplast thylakoid	类囊体	0.60000	`XP_057793825.1`
4	Chloroplast thylakoid membrane	类囊体膜	0.40000	`XP_057793825.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057793825.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:54519806`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B82,C1
`Chr2:54519857`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C28,C85
`Chr2:54520760`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C86
`Chr2:54520851`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A9,D1
`Chr2:54520962`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B101,D10
`Chr2:54520965`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A23
`Chr2:54521101`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B15,B48,B89
`Chr2:54522434`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C28,C85
`Chr2:54522505`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A21
`Chr2:54522509`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C48
`Chr2:54522707`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B31,D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793825.1

340 aa

170

340

VTT_dom

PF09335 VTT_dom 171-289 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793825.1`	Pfam	`PF09335`	VTT_dom	Domain	171	289	4.9e-23	82.7	VTT domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937842.1
TAGTTCCTGATTTAGATATTTCGAACATAGTAATAGTTTCTCTTTCTTATGATTCTCTCAGAGTTTTTCTTTTTCAAAATTCCTAGTTTTTTTCTACTGGGACATATCTCACAGATGCAGTTTGCACTTCACTGCAGGTGACTGGAGTAAATTCTTGATTATATTTTTTTCTGTACCCACTTCACACTCGTAAAATGCTATTAGGAGAAACGGCACAGGCAAGTTTTAGTCTCTCGTTCGAGAGATGGTTTTTCCCTTAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131010352
ATGCCCACCATTCCTTTAACTAGAACAGCGCCACCAAGACCGCCGTGCCTCAGTCTCTCCTCCGCCTCCGTCGCGCCCCGGCAAAGACCCAGTATTTGCTTCTCTTTGCTGAGGTTCAAGCCGAAGCGCTTCCATTTTCTGAAGCCATGTTCTTCACTCAGAGAGACCAAGAAATCACAGCAGCAAACACTTCCCAAGACTCCCGACACAGCTCCGCAGAGCCTTAGGAGATTCTTGAATTTCAACCCGAGGAGCGAGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793825.1
MPTIPLTRTAPPRPPCLSLSSASVAPRQRPSICFSLLRFKPKRFHFLKPCSSLRETKKSQQQTLPKTPDTAPQSLRRFLNFNPRSENDENKDGDAAAEEDGGGDDAAAIKGTILAGLLLVGVVGGFGIVGYVYREQINAFLTQFSGFIEGYGAAGYALFVAVYAGLEILAIPAIPLTMSAGLLFGPFTGTIIVSISGTVAASIAFLIARYFARERILKLVEGNKKFLAIDKAIGENGFKVVTLLRLSPLLPFSLGNYLYG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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