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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003337`

染色体: Chr02 坐标: 54602067-54605264 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003337`
名称	SmilChr02G003337
描述	eukaryotic translation initiation factor 3 subunit I-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	54602067 - 54605264 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010358`
GeneID	`131010358`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010358`
原始查询	`LOC131010358`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	eukaryotic translation initiation factor 3 subunit I-like
产物	eukaryotic translation initiation factor 3 subunit I-like
Arabidopsis	`AT2G46290` (AT2G46290) Transducin/WD40 repeat-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819237] identity=82.9; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os08g0308100` (OsWD40-159) - identity=81.3; qcov=1; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0002183 (cytoplasmic translational initiation); GO:0003723 (RNA binding); GO:0003743 (translation initiation factor activity); GO:0005515 (protein binding); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0071541 (eukaryotic translation initiation factor 3 complex, eIF3m)
KEGG	-
Pfam	PF00400 (WD40); PF24805 (EIF3I)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010358

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Midbody	Midbody	0.80000	`XP_057793834.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057793834.1`
3	Cytoskeleton	细胞骨架	0.60000	`XP_057793834.1`
4	Centrosome	中心体	0.40000	`XP_057793834.1`
5	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057793834.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:54602322`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B101
`Chr2:54602403`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B46,B64,C3
`Chr2:54602460`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B100,B104
`Chr2:54603167`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A23,B118,B61
`Chr2:54603313`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C53
`Chr2:54603317`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A5,B124,B27,C18,C25
`Chr2:54603706`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A23,B118,B61
`Chr2:54604678`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C4
`Chr2:54604822`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C28

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793834.1

326 aa

163

326

EIF3I

WD40

PF24805 EIF3I 1-325 aa PF00400 WD40 6-33 aa PF00400 WD40 42-80 aa PF00400 WD40 136-174 aa PF00400 WD40 188-219 aa PF00400 WD40 284-314 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793834.1`	Pfam	`PF24805`	EIF3I	Repeat	1	325	9.1e-128	426.6	EIF3I
`XP_057793834.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	6	33	1.5e-43	146.1	WD domain, G-beta repeat
`XP_057793834.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	42	80	1.5e-43	146.1	WD domain, G-beta repeat
`XP_057793834.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	136	174	1.5e-43	146.1	WD domain, G-beta repeat
`XP_057793834.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	188	219	1.5e-43	146.1	WD domain, G-beta repeat
`XP_057793834.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	284	314	1.5e-43	146.1	WD domain, G-beta repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937851.1
ATATTGCATCAATAAAATATAAATTATAAATACTATAGTACTATTTATTTTTATTTAATTTTGAGGTCATAGTGACAAAAATATAAACAACTAAGACATTATAGATGTTAGGGTTTCTCGGTTCCCATCTTCTTCTTGAGTGTTCTCAGACAACAAATTAGGGTTTTATCAGCCATTGTTGAGAGAGGTAAAGAAAAAAAAGAGGAAGGTATTAAAGATGAGGCCGATATTGATGAAAGGGCACGAGAGGCCGCTGACGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131010358
ATGAGGCCGATATTGATGAAAGGGCACGAGAGGCCGCTGACGTTTCTCAAGTACAACCGGGACGGCGATTTGCTCTTCTCCTGCGCCAAGGACCACGATCCTACCGTCTGGTTTGCCGACAACGGCGAGCGCCTCGGAACTTACCGCGGCCACAATGGCGCTGTTTGGACTTGCGACATCTCCAGGGATTCCTCAAGGCTTATAACTGGAAGTGCTGATCAGACCGCAAAGTTATGGGATGTCAGAACAGGAACTCCGCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793834.1
MRPILMKGHERPLTFLKYNRDGDLLFSCAKDHDPTVWFADNGERLGTYRGHNGAVWTCDISRDSSRLITGSADQTAKLWDVRTGTPLFTFNFDSPARSVDFAVGDKLAVITTDPFMGLPSAIHIKRIARDPEDQSGESVLTLKGPQGRINRAVWGPLNRTIVSGGEDSVIRVWDSETGKLLKESNKEEGHKKTITSLAKAADGSHFLSGSLDKSAKLWDSRTLTLIKTYVTERPVNAVAMSPLLDHVVLGGGQDASAVTT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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