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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003401`

染色体: Chr02 坐标: 55147313-55153706 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003401`
名称	SmilChr02G003401
描述	uncharacterized SmilChr02G003401
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	55147313 - 55153706 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010372`
GeneID	`131010372`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010372`
原始查询	`LOC131010372`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os01g0775600; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os01g0775600; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G06060` (AT1G06060) LisH and RanBPM domains containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837115] identity=60.6; qcov=0.981; evalue=5.64e-87; confidence=high
Rice	`Os01g0775600` - identity=64.2; qcov=0.976; evalue=1.26e-95; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0007010 (cytoskeleton organization); GO:0007166 (cell surface receptor signaling pathway)
KEGG	-
Pfam	PF10607 (CTLH)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010372

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057793853.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057793853.1`
3	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057793853.1`
4	Nucleoplasm	核质	0.60000	`XP_057793853.1`
5	Vesicle	囊泡	0.20000	`XP_057793853.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:55148595`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C15
`Chr2:55148929`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B70
`Chr2:55148988`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B21
`Chr2:55152576`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C49,C79,D4
`Chr2:55152589`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C83

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793853.1

215 aa

108

215

CTLH

PF10607 CTLH 54-192 aa

XP_057793854.1

212 aa

106

212

CTLH

PF10607 CTLH 51-189 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793853.1`	Pfam	`PF10607`	CTLH	Domain	54	192	1.2e-33	117.0	CTLH/CRA C-terminal to LisH motif domain
`XP_057793854.1`	Pfam	`PF10607`	CTLH	Domain	51	189	1.1e-33	117.0	CTLH/CRA C-terminal to LisH motif domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937870.1
AATTAACCATATGATTGTAATTCAATATAGGTGTATATTGATTCTCCAAAAGAGAAAAATTATATTCGGAAATAATTTAAAAATCACGTGCGCATCACTTAAGGAGCAAATGAGTATTCCTGCATTTACTTTTGAAAAAATCAAAGTCGTCGAACAATAGTTAGGAGTTGCCGCTACTTTCATCTTTAACCGCCACTAACCGGAGCGTGACAGACCGGAGAGAGGCGATCTTCACTCCCGTACGACAACGCAACGTCGTC...

XM_057937871.1
AATTAACCATATGATTGTAATTCAATATAGGTGTATATTGATTCTCCAAAAGAGAAAAATTATATTCGGAAATAATTTAAAAATCACGTGCGCATCACTTAAGGAGCAAATGAGTATTCCTGCATTTACTTTTGAAAAAATCAAAGTCGTCGAACAATAGTTAGGAGTTGCCGCTACTTTCATCTTTAACCGCCACTAACCGGAGCGTGACAGACCGGAGAGAGGCGATCTTCACTCCCGTACGACAACGCAACGTCGTC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131010372
ATGGATGCTGATCCACTGCAGTTTGGGAACATTGATGTAAATGAGAGTGATATCCACGCAATTGTTCTTTCATATCTTGTACACAATTGCTTCAAAGACACACTGGAGTCATTCGTTTCATGTACTGGGATGAAGCAACCTGCTGATCATCTGCAGGACATGGAAAAAAGAAAAAGAATCTATCATTTTGCATTGGACGGGAATGCATCCAAAGCCATTGAGATGACTGAAGAATTTGCGCCTGGCTTGTTGGAGGAAAA...

LOC131010372
ATGGAGCTAATGTTTGACTATTCTGATGTAAATGAGAGTGATATCCACGCAATTGTTCTTTCATATCTTGTACACAATTGCTTCAAAGACACACTGGAGTCATTCGTTTCATGTACTGGGATGAAGCAACCTGCTGATCATCTGCAGGACATGGAAAAAAGAAAAAGAATCTATCATTTTGCATTGGACGGGAATGCATCCAAAGCCATTGAGATGACTGAAGAATTTGCGCCTGGCTTGTTGGAGGAAAATAAGGATTT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057793853.1
MDADPLQFGNIDVNESDIHAIVLSYLVHNCFKDTLESFVSCTGMKQPADHLQDMEKRKRIYHFALDGNASKAIEMTEEFAPGLLEENKDLHFDLLSLHFVELVSSHKTQEALLFAQCQLTDFGKEQKYVKKLEDFMALLAYDEPEKSPMFHLLSSEHRQYVAESLNRAILAHTKLPNYSAMERLIQQTTVVRQCLSQELGKDGHKPFSLKDFLKS

XP_057793854.1
MELMFDYSDVNESDIHAIVLSYLVHNCFKDTLESFVSCTGMKQPADHLQDMEKRKRIYHFALDGNASKAIEMTEEFAPGLLEENKDLHFDLLSLHFVELVSSHKTQEALLFAQCQLTDFGKEQKYVKKLEDFMALLAYDEPEKSPMFHLLSSEHRQYVAESLNRAILAHTKLPNYSAMERLIQQTTVVRQCLSQELGKDGHKPFSLKDFLKS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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